More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0459 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0459  twitching motility protein  100 
 
 		 364 aa  739    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0174567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  51.42 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  50.86 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  48.86 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  50.29 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  50.28 
 
 		 356 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  50 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  48.58 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  48.57 
 
 		 360 aa  338  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  49.01 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  49.43 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  49.01 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  46.72 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  46.05 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.23 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.23 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.77 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  46.06 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  45.89 
 
 		 372 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  46.94 
 
 		 344 aa  316  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  46.94 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  46.94 
 
 		 344 aa  315  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  46.65 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  46.65 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  46.8 
 
 		 345 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  47.45 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  47.45 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  45.77 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  48.05 
 
 		 344 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  46.51 
 
 		 345 aa  309  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  44.9 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  44.9 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  46.2 
 
 		 345 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  48.1 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  48.05 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  47.52 
 
 		 344 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  46.11 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.66 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  46.13 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  46.36 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  46.2 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  48.05 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  46.36 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  46.2 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  45.91 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.64 
 
 		 349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  45.14 
 
 		 351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  44.54 
 
 		 365 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  47.23 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  47.23 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  47.23 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.15 
 
 		 347 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  46.36 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  45.91 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  46.85 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  45.91 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  45.91 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  45.91 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  45.32 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.95 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  45.32 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  45.32 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  45.91 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  47.67 
 
 		 345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  44.82 
 
 		 366 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  45.48 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  45.48 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  45.48 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.77 
 
 		 349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  45.95 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  46.06 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  44.54 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  44.54 
 
 		 366 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  47.23 
 
 		 344 aa  301  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  46.65 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  45.03 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  45.06 
 
 		 345 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  45.09 
 
 		 347 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  45.61 
 
 		 362 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  46.04 
 
 		 345 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  45.93 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  44.88 
 
 		 346 aa  299  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  46.65 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  42.41 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  46.11 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  45.06 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  43.97 
 
 		 351 aa  295  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  44.19 
 
 		 345 aa  295  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0165  twitching motility protein  44.19 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.753648  normal  0.198553 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  45.29 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1884  twitching motility protein  44.74 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  43.27 
 
 		 366 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  43.67 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  42.45 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  45.19 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>