More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4827 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  100 
 
 		 366 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  65.93 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  66.39 
 
 		 365 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  65.28 
 
 		 365 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  67.24 
 
 		 366 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  67.24 
 
 		 366 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  66.95 
 
 		 366 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  64.09 
 
 		 363 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  64.01 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  66.29 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  64.82 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  63.74 
 
 		 366 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  59.72 
 
 		 375 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  60.29 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  56.41 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  54.6 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  55.87 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  55.62 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  56.66 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  53.2 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  54.13 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  55.12 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  54.75 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.62 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.96 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  52.89 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  53.14 
 
 		 360 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  52.53 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  50.14 
 
 		 349 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  56.04 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  52.84 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.06 
 
 		 347 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  52.35 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  52.57 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  50 
 
 		 351 aa  361  9e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.05 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  52.05 
 
 		 344 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  51.76 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  48.9 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  48.9 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  53.89 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.43 
 
 		 363 aa  355  8.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  50.44 
 
 		 349 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  52.07 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  51.18 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  48.68 
 
 		 351 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  51.18 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  50 
 
 		 437 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.86 
 
 		 360 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  51.48 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  49.72 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.58 
 
 		 360 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  51.48 
 
 		 344 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  51.18 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  51.18 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.89 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.89 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  49.28 
 
 		 361 aa  352  7e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  50.9 
 
 		 347 aa  352  8e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  51.5 
 
 		 347 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  50.42 
 
 		 427 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.59 
 
 		 345 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.89 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  50.89 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  50.42 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  49.45 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  51.48 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.48 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  52.57 
 
 		 358 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  50.89 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49 
 
 		 383 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  51.48 
 
 		 347 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  51.18 
 
 		 344 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  51.18 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.59 
 
 		 345 aa  348  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  50.74 
 
 		 349 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  50.74 
 
 		 349 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  50.89 
 
 		 347 aa  347  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.6 
 
 		 372 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 		 353 aa  348  1e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  51.17 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  50.89 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  50.89 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  49.28 
 
 		 349 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50.58 
 
 		 344 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  54.18 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  50 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  49.14 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  51.18 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  49.41 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.56 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.46 
 
 		 362 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  51.8 
 
 		 344 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>