More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3736 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  98.17 
 
 		 383 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  77.78 
 
 		 387 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  83.33 
 
 		 383 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  100 
 
 		 383 aa  784    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  75.07 
 
 		 386 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  76.76 
 
 		 387 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  75.52 
 
 		 388 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  69.73 
 
 		 437 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  68.31 
 
 		 388 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  69.4 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  68.58 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  68.58 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  58.74 
 
 		 383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  55.16 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  52.73 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  49.57 
 
 		 349 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  53.8 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  54.12 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.26 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.76 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  53.11 
 
 		 358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  51.83 
 
 		 358 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.98 
 
 		 339 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  51.7 
 
 		 366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  51.27 
 
 		 351 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  50.57 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  51.57 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  50 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  51.16 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.73 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  48.56 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.73 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  51.16 
 
 		 363 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.45 
 
 		 366 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  49.57 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.74 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  50.14 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  48.15 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50.86 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  51.76 
 
 		 362 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50.43 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.14 
 
 		 347 aa  346  4e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  50 
 
 		 347 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  51.74 
 
 		 345 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  50.57 
 
 		 347 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  49.29 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  51.45 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  51.45 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  51.74 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  49.43 
 
 		 347 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  51.45 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  51.45 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  50.29 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.44 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  51.16 
 
 		 349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  50.29 
 
 		 347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  51.16 
 
 		 345 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.43 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.69 
 
 		 360 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  342  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  50.87 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  52.06 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  48.87 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  50.57 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  49.71 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.71 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.99 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  51.57 
 
 		 362 aa  339  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  48.46 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  45.63 
 
 		 363 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  49.71 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  50.29 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  51.73 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.43 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  48.14 
 
 		 347 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  49.71 
 
 		 345 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.71 
 
 		 370 aa  335  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  49.28 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.82 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.99 
 
 		 347 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  49.43 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  51.61 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.71 
 
 		 347 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.38 
 
 		 344 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  48.28 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  50 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  48.56 
 
 		 344 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.43 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  49.28 
 
 		 347 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  49.14 
 
 		 349 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>