More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3244 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  100 
 
 
356 aa  722    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  55 
 
 
360 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  57.02 
 
 
349 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  53.91 
 
 
351 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  56.5 
 
 
339 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.99 
 
 
360 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  51.53 
 
 
365 aa  381  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.01 
 
 
351 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  55.62 
 
 
348 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  54.77 
 
 
351 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  49.14 
 
 
350 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  54.62 
 
 
360 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.14 
 
 
372 aa  364  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  51.01 
 
 
350 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  51.01 
 
 
350 aa  362  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50 
 
 
368 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  54.66 
 
 
344 aa  361  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  48.3 
 
 
374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  51.94 
 
 
347 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  53.8 
 
 
350 aa  353  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50.44 
 
 
366 aa  352  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  53.92 
 
 
351 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 
365 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  50.15 
 
 
366 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  53.45 
 
 
367 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  51.85 
 
 
358 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.71 
 
 
397 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  52.2 
 
 
375 aa  345  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  50 
 
 
368 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  52.08 
 
 
352 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  48.42 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50.15 
 
 
365 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  49.13 
 
 
365 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  49 
 
 
360 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  49.71 
 
 
366 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.07 
 
 
372 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  49.42 
 
 
366 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  48.27 
 
 
345 aa  342  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50.44 
 
 
363 aa  342  7e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  49.12 
 
 
366 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  49.29 
 
 
378 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.71 
 
 
362 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  49.85 
 
 
566 aa  339  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  49.43 
 
 
365 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  45.74 
 
 
362 aa  336  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.82 
 
 
370 aa  335  5.999999999999999e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  48.57 
 
 
360 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  47.08 
 
 
347 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.29 
 
 
347 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  46.78 
 
 
358 aa  333  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.09 
 
 
347 aa  333  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  48.64 
 
 
345 aa  334  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.4 
 
 
382 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  45.48 
 
 
374 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  48.57 
 
 
363 aa  332  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  45.09 
 
 
347 aa  332  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  49.7 
 
 
357 aa  331  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.43 
 
 
347 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  47.11 
 
 
403 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.43 
 
 
347 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  46.22 
 
 
388 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  49.12 
 
 
358 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.51 
 
 
347 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  48.06 
 
 
360 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  47.13 
 
 
361 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  48.31 
 
 
360 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  47.75 
 
 
437 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  48.53 
 
 
358 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  44.94 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  48.07 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  48.07 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.53 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  46.91 
 
 
427 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 
349 aa  326  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  46.63 
 
 
427 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  44.38 
 
 
386 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  46.49 
 
 
346 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  46.53 
 
 
346 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  46.63 
 
 
427 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  49.39 
 
 
372 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.66 
 
 
358 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.01 
 
 
374 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  44.94 
 
 
387 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  48.49 
 
 
346 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.77 
 
 
344 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  45.51 
 
 
383 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  44.77 
 
 
345 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.77 
 
 
344 aa  323  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  48.19 
 
 
347 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  47.59 
 
 
347 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.9 
 
 
383 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  46.38 
 
 
356 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  47.29 
 
 
369 aa  322  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  46.78 
 
 
347 aa  322  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.49 
 
 
366 aa  322  5e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  46.04 
 
 
344 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  46.57 
 
 
345 aa  322  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  48.68 
 
 
358 aa  322  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  47.75 
 
 
383 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.1 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>