More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0669 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  100 
 
 		 358 aa  725    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  66 
 
 		 366 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  67.14 
 
 		 366 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  58.4 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  54.24 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  51.98 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  55.37 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  53.39 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  51.55 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  52.69 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  54.52 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  53.95 
 
 		 427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  53.95 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  53.26 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  54.08 
 
 		 375 aa  358  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  54.11 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  51.4 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  51.28 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  52.41 
 
 		 383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  52.12 
 
 		 383 aa  352  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  51.4 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  53.01 
 
 		 370 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.43 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48.58 
 
 		 351 aa  345  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  48.03 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  48.6 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  48.6 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  48.31 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  51.6 
 
 		 362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  47.88 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  47.86 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0229  twitching motility protein  51.56 
 
 		 374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.87 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  47.58 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  47.44 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  48.3 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  50.3 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.43 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  48.66 
 
 		 358 aa  332  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  50.57 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  46.11 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.12 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  50.29 
 
 		 397 aa  328  9e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  51.3 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  47.37 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  47.56 
 
 		 378 aa  325  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  48.02 
 
 		 377 aa  325  9e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  48.99 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  47.06 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  47.06 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  49.72 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.43 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  47.01 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  48.17 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  48.68 
 
 		 356 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.61 
 
 		 360 aa  322  6e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  50.3 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  45.45 
 
 		 360 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  46.02 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  47.61 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.92 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.04 
 
 		 372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  46.42 
 
 		 388 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  45.48 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  48.43 
 
 		 368 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  45.92 
 
 		 374 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  47.01 
 
 		 378 aa  317  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  46.69 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.02 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  47.28 
 
 		 378 aa  315  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  45.25 
 
 		 374 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  47.56 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  46.47 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  46.15 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  48.53 
 
 		 382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  49.13 
 
 		 566 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  46.42 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  45.82 
 
 		 378 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  46.47 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  45.98 
 
 		 357 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.56 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  47.4 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  45.35 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  46.13 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  44.57 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  44.99 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  47.97 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  47.84 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  46.89 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  44.99 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  44.7 
 
 		 378 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  44.79 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  45.3 
 
 		 373 aa  308  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  45.58 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  45.58 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  45.58 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  45.95 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  45.14 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  44.54 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>