More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2106 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  100 
 
 
378 aa  776    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  75.13 
 
 
377 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  74.6 
 
 
378 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  74.46 
 
 
388 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  75.4 
 
 
378 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  71.96 
 
 
378 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  70.37 
 
 
378 aa  569  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  70.63 
 
 
378 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  69.84 
 
 
378 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  70.63 
 
 
378 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  69.31 
 
 
378 aa  566  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  67.99 
 
 
378 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  68.25 
 
 
378 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  66.67 
 
 
378 aa  551  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  66.4 
 
 
379 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  66.14 
 
 
379 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  64.81 
 
 
379 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  65.34 
 
 
379 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  67.91 
 
 
390 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  69.05 
 
 
378 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  66.84 
 
 
381 aa  532  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  68.44 
 
 
390 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  64.02 
 
 
381 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  64.48 
 
 
373 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  63.66 
 
 
405 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  63.66 
 
 
376 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  64.74 
 
 
381 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  63.46 
 
 
387 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  62.98 
 
 
382 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  62.71 
 
 
372 aa  473  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  61.1 
 
 
380 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  60.49 
 
 
385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  59.84 
 
 
376 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  59.56 
 
 
376 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  59.17 
 
 
370 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  60.11 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  59.83 
 
 
370 aa  448  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  61.54 
 
 
372 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  60.11 
 
 
373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  57.85 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  58.13 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  57.78 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  57.78 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  57.78 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  57.22 
 
 
370 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  59.65 
 
 
370 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  58.47 
 
 
370 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  59.14 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  58.47 
 
 
370 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  57.22 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  59.54 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  58.47 
 
 
370 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  58.19 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  59.54 
 
 
376 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  58.4 
 
 
370 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  59.14 
 
 
397 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  56.16 
 
 
375 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  58 
 
 
390 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  59.54 
 
 
409 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  57.51 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  58.09 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  54.22 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  57.51 
 
 
373 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  56.98 
 
 
391 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  58.21 
 
 
375 aa  408  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  56.65 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  55.2 
 
 
370 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  54.76 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  56.48 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  56.77 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  53.68 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  54.83 
 
 
368 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  52.76 
 
 
377 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  55.46 
 
 
370 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  55.36 
 
 
384 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  51.57 
 
 
371 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  51.99 
 
 
364 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  50.54 
 
 
395 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  50.28 
 
 
372 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  50.14 
 
 
387 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  49.43 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  49.17 
 
 
376 aa  351  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.85 
 
 
368 aa  339  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  48.56 
 
 
387 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  45.66 
 
 
401 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  49.57 
 
 
392 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.64 
 
 
370 aa  329  4e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  47.83 
 
 
395 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  48.12 
 
 
387 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  48.12 
 
 
387 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.14 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  49.28 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  45.45 
 
 
404 aa  322  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  45.82 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  46.09 
 
 
380 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.35 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  47.83 
 
 
388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  44.23 
 
 
382 aa  319  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  44.97 
 
 
366 aa  318  9e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  47.01 
 
 
358 aa  317  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>