More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1211 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  100 
 
 		 362 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  77.56 
 
 		 362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  78.43 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  71.02 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  68.73 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  59.49 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  55.56 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  53.82 
 
 		 386 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  52.37 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  52.65 
 
 		 383 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  53.53 
 
 		 383 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  52.06 
 
 		 387 aa  352  5e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.67 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  52.65 
 
 		 387 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  52.19 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  53.08 
 
 		 427 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  53.08 
 
 		 427 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  52.79 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  51.78 
 
 		 383 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  51.48 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  49.72 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  52.3 
 
 		 359 aa  342  8e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  51.6 
 
 		 358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  48.88 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  46.96 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  52.79 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  48.99 
 
 		 372 aa  319  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.82 
 
 		 350 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.53 
 
 		 350 aa  315  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48.19 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.84 
 
 		 365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.05 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.73 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  46.89 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.06 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  45.76 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  45.76 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.56 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  45.45 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  46.05 
 
 		 363 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44.9 
 
 		 366 aa  308  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  45.43 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.31 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.72 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  47.6 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.01 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  44.92 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  48.35 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  44.92 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  45.58 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  45.45 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  43.63 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  45.48 
 
 		 365 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.87 
 
 		 368 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  46.18 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.56 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  50.76 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  44.87 
 
 		 365 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.71 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  47.42 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  47.42 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  47.87 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.42 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  48.01 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.35 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.11 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  42.57 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  47.46 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  47.02 
 
 		 345 aa  296  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  46.97 
 
 		 345 aa  296  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.77 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.97 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  43.66 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.78 
 
 		 345 aa  295  9e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.11 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  47.42 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  44.19 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  45.76 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.11 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.11 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  47.42 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  47.42 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  47.11 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.51 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  46.28 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  46.95 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  47.11 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.43 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  42.9 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  44.11 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  46.81 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.15 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  47.77 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  45.82 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  46.5 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  45.54 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  44.68 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  44.58 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  44.44 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  44.44 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>