More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0256 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  100 
 
 		 359 aa  724    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  60.34 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  60.63 
 
 		 366 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  58.4 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  51.99 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.28 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  52.26 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  52.26 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  52.42 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  50.14 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  50.14 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  51.85 
 
 		 427 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  51.85 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  48.73 
 
 		 387 aa  345  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  52.3 
 
 		 362 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  49.86 
 
 		 387 aa  338  7e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  48.73 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  49.72 
 
 		 375 aa  335  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  46.15 
 
 		 358 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  52.59 
 
 		 370 aa  334  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  47.88 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  50.86 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.3 
 
 		 386 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0229  twitching motility protein  52.14 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  51.15 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  50.57 
 
 		 383 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.7 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  45.4 
 
 		 351 aa  316  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.66 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  47.29 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  44.02 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.8 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.02 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  43.43 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  47.25 
 
 		 356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  44.85 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.81 
 
 		 349 aa  305  7e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.51 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.29 
 
 		 351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.52 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  47.26 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.13 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.5 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  46.69 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  47.18 
 
 		 352 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.59 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  45.58 
 
 		 360 aa  299  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  45.87 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  46.59 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  46.31 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  43.1 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.99 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.47 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  44.92 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  46.11 
 
 		 345 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.47 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  44.63 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  45.74 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  46.75 
 
 		 350 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  44.94 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  42.74 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.25 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  45.45 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.16 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  44.87 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  44.25 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  45.9 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  45.22 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  45.22 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  44.61 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  44.74 
 
 		 344 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  44.41 
 
 		 344 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.86 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  47.73 
 
 		 344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.19 
 
 		 347 aa  289  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  44.87 
 
 		 349 aa  288  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.99 
 
 		 347 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  44.93 
 
 		 344 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  44.16 
 
 		 363 aa  288  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  44.35 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  47.38 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  45.45 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  44.54 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.13 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  45.74 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  44.54 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  44.54 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  44.54 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  44.54 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  44.84 
 
 		 345 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  46.78 
 
 		 382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.57 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  44.57 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  44.57 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  44.57 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  42.36 
 
 		 358 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  44.57 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  43.98 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.75 
 
 		 360 aa  285  9e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.45 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>