More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0245 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  100 
 
 
359 aa  731    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  62.65 
 
 
362 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  52.27 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  51.43 
 
 
365 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.42 
 
 
375 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  51.59 
 
 
363 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  53.06 
 
 
366 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  53.06 
 
 
366 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  53.18 
 
 
365 aa  349  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51 
 
 
366 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  51.01 
 
 
368 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.72 
 
 
365 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  50.71 
 
 
366 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  50.43 
 
 
366 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.87 
 
 
374 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  50.57 
 
 
349 aa  338  8e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50.43 
 
 
368 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  51.57 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.08 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.28 
 
 
372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.58 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.58 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.58 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 
345 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  51.42 
 
 
351 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  49.57 
 
 
347 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  51.79 
 
 
344 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.15 
 
 
349 aa  334  2e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.31 
 
 
360 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  50.58 
 
 
345 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  50.58 
 
 
345 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1251  pilus retraction protein PilT  49 
 
 
360 aa  333  4e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.58 
 
 
345 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  50.58 
 
 
347 aa  332  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50 
 
 
345 aa  332  6e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  49.42 
 
 
345 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  49.42 
 
 
345 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  49.42 
 
 
345 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  49.56 
 
 
345 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  50 
 
 
344 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  48.32 
 
 
374 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  49.42 
 
 
349 aa  330  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  49.13 
 
 
345 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  49.29 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.71 
 
 
366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50 
 
 
345 aa  329  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  49.13 
 
 
345 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  49.71 
 
 
345 aa  328  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  50 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0998  putative type II/IV secretion system protein  49.01 
 
 
373 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.93 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  49.12 
 
 
344 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  49.12 
 
 
344 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  48.06 
 
 
346 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.15 
 
 
344 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  48.84 
 
 
345 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.43 
 
 
349 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.85 
 
 
344 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  48.71 
 
 
403 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  47.69 
 
 
344 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  50 
 
 
370 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  47.93 
 
 
351 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49 
 
 
344 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.84 
 
 
345 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 
344 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  48.84 
 
 
344 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.65 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  47.18 
 
 
356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  46.93 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  48.3 
 
 
346 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  45.98 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.7 
 
 
347 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  46.87 
 
 
345 aa  318  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.09 
 
 
397 aa  318  7.999999999999999e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  48.55 
 
 
344 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  48.29 
 
 
350 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.89 
 
 
437 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.97 
 
 
347 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.55 
 
 
344 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  48.81 
 
 
345 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  48.81 
 
 
344 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  47.84 
 
 
347 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  47.38 
 
 
347 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  46.72 
 
 
361 aa  317  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  47.83 
 
 
360 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  45.56 
 
 
374 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  48.21 
 
 
345 aa  315  7e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1145  twitching motility protein PilT  46.46 
 
 
353 aa  315  7e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0148447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  47.38 
 
 
347 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  315  9e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.02 
 
 
345 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.96 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  48.02 
 
 
430 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.26 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  48.07 
 
 
347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  48.3 
 
 
383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  46.94 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  47.55 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  47.63 
 
 
382 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  48.96 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>