More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1126 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  100 
 
 		 430 aa  864    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  57.55 
 
 		 566 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  60.05 
 
 		 397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  58.52 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  63.32 
 
 		 378 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  63.71 
 
 		 362 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  59.01 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  52.37 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  54.1 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  51.7 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  52.84 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.55 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  53.18 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.57 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  53.94 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  51.16 
 
 		 360 aa  363  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  56.31 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  50.27 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  53.67 
 
 		 344 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  55.12 
 
 		 344 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  55.12 
 
 		 344 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  53.08 
 
 		 344 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.6 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  51.45 
 
 		 356 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  53.64 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  53.92 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.74 
 
 		 360 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  51.15 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  54.33 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.14 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  53.64 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  53.64 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  52.77 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.14 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  50 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  50.85 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  53.35 
 
 		 345 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.14 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.06 
 
 		 345 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  356  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  51.96 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  54.35 
 
 		 350 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  51.69 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  55.35 
 
 		 344 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  51.02 
 
 		 347 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  49.86 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  54.05 
 
 		 350 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  48.17 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  52.89 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.87 
 
 		 347 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  52.71 
 
 		 347 aa  352  5e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  51.6 
 
 		 345 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  53.06 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  52.28 
 
 		 347 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  51.46 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  52.28 
 
 		 347 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.19 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  51.3 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  51.45 
 
 		 349 aa  351  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  52.48 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  49.42 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  49.42 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  51.8 
 
 		 347 aa  350  4e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  50.43 
 
 		 345 aa  349  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 		 344 aa  348  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  53.2 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.43 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  51.73 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  51.51 
 
 		 347 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  52.52 
 
 		 339 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  51.81 
 
 		 347 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  51.81 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  47.14 
 
 		 360 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  52.27 
 
 		 347 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  48.55 
 
 		 344 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  48.55 
 
 		 344 aa  344  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  48.99 
 
 		 360 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  51.8 
 
 		 344 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  51.66 
 
 		 356 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  51.51 
 
 		 347 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  49.86 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  51.16 
 
 		 347 aa  342  5.999999999999999e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  51.45 
 
 		 344 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  52.2 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  50.9 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  50.9 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.8 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51.44 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.71 
 
 		 351 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  51.81 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  49.13 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  51.61 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>