More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3084 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3084  twitching motility protein  100 
 
 		 360 aa  740    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0409  twitching motility protein  53.31 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  52.07 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.06 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  51.03 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  51.33 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  51.17 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  51.76 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  51.62 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50 
 
 		 349 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  50 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  49.86 
 
 		 349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.3 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  51.47 
 
 		 344 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.29 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  342  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.88 
 
 		 344 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  50.57 
 
 		 347 aa  341  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.34 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.29 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 		 347 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  51.18 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  48.39 
 
 		 349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.29 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.29 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  51.04 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.29 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.58 
 
 		 345 aa  339  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.29 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.65 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  51.18 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.12 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  51.03 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.85 
 
 		 347 aa  335  7e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  50.59 
 
 		 344 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  50.15 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.15 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  50.59 
 
 		 344 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  49.26 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  49.26 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  50.15 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  49.12 
 
 		 366 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  50.59 
 
 		 344 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.07 
 
 		 365 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  50 
 
 		 346 aa  331  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  49.27 
 
 		 344 aa  331  9e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  50.44 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.56 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  49.26 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  50 
 
 		 347 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  49.26 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  50.74 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  47.34 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  47.25 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  49.42 
 
 		 349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  49.56 
 
 		 347 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  49.27 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  49.12 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  49.27 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50.45 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  45.61 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  49.85 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  49.12 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  46.84 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  47.67 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  48.67 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  45.79 
 
 		 366 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.83 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.12 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  45.51 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  45.51 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  45.48 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  48.66 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  46.31 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  47.62 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  48.35 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.84 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.52 
 
 		 350 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  48.97 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  45.48 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.82 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  46.55 
 
 		 365 aa  322  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  47.94 
 
 		 351 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  45.69 
 
 		 360 aa  322  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  47.79 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  47.63 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.34 
 
 		 346 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  48.55 
 
 		 347 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  49.57 
 
 		 360 aa  322  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  48.55 
 
 		 347 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  46.84 
 
 		 365 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47.32 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  48.55 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  46.35 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  47.9 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  48.68 
 
 		 347 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>