More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1808 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  100 
 
 		 432 aa  880    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  79.49 
 
 		 362 aa  569  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  78.43 
 
 		 362 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  67.51 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  67.04 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  59.49 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  56.41 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51.86 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  50.71 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  52.07 
 
 		 383 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  51.01 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  50.72 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  50.14 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  50.43 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  49.72 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.89 
 
 		 437 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  51.15 
 
 		 359 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  50.14 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  49.57 
 
 		 427 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  49.57 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  49.28 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  49.72 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  47.86 
 
 		 372 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  48.42 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.91 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  46.92 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  44.67 
 
 		 358 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.82 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  44.27 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.69 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  47.62 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  51.01 
 
 		 367 aa  303  6.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  44.79 
 
 		 365 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  45.27 
 
 		 372 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  46.55 
 
 		 365 aa  300  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  46.33 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  45.75 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  46.36 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.56 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.16 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  43.91 
 
 		 358 aa  296  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  45.16 
 
 		 365 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  44.73 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  44.73 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  45.45 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.29 
 
 		 347 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  44.44 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  45.99 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  42.55 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  44.28 
 
 		 368 aa  293  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.11 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  46.22 
 
 		 370 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  43.95 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  44.35 
 
 		 347 aa  292  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  43.14 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  46.04 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  43.9 
 
 		 345 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  42.02 
 
 		 360 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.35 
 
 		 368 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  44.15 
 
 		 345 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  43.73 
 
 		 363 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44 
 
 		 366 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  44.48 
 
 		 344 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  44 
 
 		 366 aa  289  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  44.48 
 
 		 344 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.39 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  43.73 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  44.06 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  46.18 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  43.92 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  43.4 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  44.15 
 
 		 345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  43.86 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  43.6 
 
 		 344 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  43.86 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  44.64 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  44.51 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  45.9 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  43.86 
 
 		 345 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  43.86 
 
 		 345 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  45.4 
 
 		 345 aa  285  9e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  43.86 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.15 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  46.06 
 
 		 360 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  43.53 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  43.11 
 
 		 344 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  45.72 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  43.57 
 
 		 345 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  43.57 
 
 		 345 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  43.48 
 
 		 358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  44.48 
 
 		 344 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  43.11 
 
 		 344 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.9 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  44.48 
 
 		 356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  43.57 
 
 		 345 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  44.96 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  46.34 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  44.19 
 
 		 347 aa  284  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  42.98 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>