More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2223 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  100 
 
 		 366 aa  742    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  81.97 
 
 		 366 aa  634    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  67.14 
 
 		 358 aa  491  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  60.63 
 
 		 359 aa  420  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  53.98 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  53.12 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  53.37 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  53.09 
 
 		 427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  51.71 
 
 		 383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  53.09 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  52.53 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  53.14 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  51.72 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  52.86 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  52.44 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  52.72 
 
 		 383 aa  358  9e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  53.75 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  51.85 
 
 		 383 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  50.56 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  50.84 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  50.86 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  53.04 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  50.43 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  53.18 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  50.59 
 
 		 351 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48.43 
 
 		 351 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  50.58 
 
 		 351 aa  342  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  50.98 
 
 		 372 aa  341  9e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  49.86 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  47.63 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.43 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  51.6 
 
 		 360 aa  338  7e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  49.15 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  48.3 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  48.88 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  46.61 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  49.15 
 
 		 366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  48.17 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  48.17 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.06 
 
 		 397 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0229  twitching motility protein  51.3 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  47.89 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  49.15 
 
 		 375 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  48.36 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  53.12 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  48.86 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  48.3 
 
 		 363 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  46.74 
 
 		 372 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  48.01 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  51.49 
 
 		 360 aa  328  8e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  49.28 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  50.99 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.86 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  48.86 
 
 		 365 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  49.26 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  51.8 
 
 		 566 aa  325  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.18 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  51.34 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.83 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  48.94 
 
 		 344 aa  322  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  50 
 
 		 432 aa  322  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  47.99 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  44.93 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  45.92 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  44.94 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  47.7 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  46.18 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  50.3 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  45.53 
 
 		 370 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  48.14 
 
 		 360 aa  319  6e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  49.56 
 
 		 350 aa  318  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  46.69 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  46.69 
 
 		 372 aa  318  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  44.97 
 
 		 378 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 		 350 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  49.54 
 
 		 351 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  52.1 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  46.01 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  47.13 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  47.25 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  44.48 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  45.25 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  46.89 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  45.95 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  45.82 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  44.38 
 
 		 378 aa  315  9e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  45.66 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  47.19 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  45.66 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  49.26 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  49.01 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  44.8 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  50.78 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  45.56 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  48.95 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  43.85 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  45.95 
 
 		 370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  46.2 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  47.92 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  44.38 
 
 		 381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>