More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0335 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  100 
 
 
398 aa  807    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  60.8 
 
 
402 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  63.09 
 
 
399 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  61.99 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  54.35 
 
 
373 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  47.98 
 
 
387 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  48.39 
 
 
383 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  47.74 
 
 
386 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  46.11 
 
 
388 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  48.43 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  47.06 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.17 
 
 
437 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  48.01 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  47.06 
 
 
427 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  47.06 
 
 
427 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  47.06 
 
 
427 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.88 
 
 
383 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.05 
 
 
383 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.69 
 
 
360 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  46.67 
 
 
566 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  45.87 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  45.27 
 
 
360 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  47.13 
 
 
351 aa  311  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  45.58 
 
 
362 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  44.99 
 
 
350 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  46.51 
 
 
358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  48 
 
 
360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.71 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  45.61 
 
 
366 aa  302  8.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  46.02 
 
 
362 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  42.58 
 
 
366 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45.82 
 
 
351 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  47.66 
 
 
360 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  43.98 
 
 
366 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  46.67 
 
 
356 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  48.21 
 
 
350 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  45.53 
 
 
375 aa  299  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.51 
 
 
350 aa  298  9e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  48.49 
 
 
347 aa  298  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  45.86 
 
 
365 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  46.15 
 
 
369 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.72 
 
 
349 aa  296  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  46.13 
 
 
356 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  48.81 
 
 
344 aa  296  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  45.69 
 
 
357 aa  296  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  44.19 
 
 
396 aa  295  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  45.01 
 
 
375 aa  295  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  47.49 
 
 
347 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.7 
 
 
345 aa  295  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.51 
 
 
358 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  44.1 
 
 
372 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  43.95 
 
 
397 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  46.13 
 
 
345 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  47.11 
 
 
347 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  44.54 
 
 
366 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  46.15 
 
 
372 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  42.55 
 
 
432 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  44.94 
 
 
356 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  46.42 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  46.42 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.85 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  46.42 
 
 
345 aa  293  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  44.57 
 
 
366 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  47.15 
 
 
349 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  47.15 
 
 
349 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  42.74 
 
 
359 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.65 
 
 
345 aa  293  5e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.95 
 
 
382 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  46.42 
 
 
345 aa  292  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  46.5 
 
 
347 aa  292  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  46.13 
 
 
345 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  44.25 
 
 
366 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  45.43 
 
 
358 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  47.63 
 
 
344 aa  292  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  44.25 
 
 
366 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  44.84 
 
 
346 aa  292  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  45.56 
 
 
349 aa  292  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  45.85 
 
 
345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  46.42 
 
 
345 aa  292  9e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  45.85 
 
 
345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  42.09 
 
 
358 aa  291  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  45.85 
 
 
345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  44.84 
 
 
346 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  47.93 
 
 
344 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  48.19 
 
 
347 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  47.77 
 
 
356 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  48.19 
 
 
347 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.02 
 
 
349 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  45.4 
 
 
356 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  47.72 
 
 
347 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  47.31 
 
 
344 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  47.49 
 
 
348 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  47.31 
 
 
344 aa  289  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  45.2 
 
 
345 aa  289  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  48.49 
 
 
344 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  46.5 
 
 
347 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  46.42 
 
 
345 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  49.7 
 
 
350 aa  288  1e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  44 
 
 
372 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  45.09 
 
 
374 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>