More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09510 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  100 
 
 		 362 aa  728    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  77.56 
 
 		 362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  79.49 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  67.61 
 
 		 356 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  65.45 
 
 		 396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  59.77 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  56.66 
 
 		 375 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  52.06 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51 
 
 		 383 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  52.94 
 
 		 386 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  52.94 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  51.74 
 
 		 383 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  48.3 
 
 		 358 aa  334  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  52.03 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  51.91 
 
 		 437 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  50.86 
 
 		 359 aa  332  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  51.18 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  50.59 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  48.42 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  50.14 
 
 		 427 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  50.14 
 
 		 427 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  50.3 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  49.28 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  49.28 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.32 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  47.86 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  51.61 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.55 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  44.38 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  49.09 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  46.72 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.31 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.63 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  46.22 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  45.16 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  47.43 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  45.33 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  45.33 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  45.93 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  45.04 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  45.32 
 
 		 344 aa  299  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  45.93 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  45.93 
 
 		 344 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.4 
 
 		 351 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.88 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  45.06 
 
 		 344 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.59 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  45.45 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  45.93 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  43.6 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.66 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.9 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  46.53 
 
 		 345 aa  295  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  46.53 
 
 		 345 aa  295  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  44.64 
 
 		 374 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  46.13 
 
 		 350 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.99 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  45.06 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.99 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  44.29 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  44.77 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  45.27 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.6 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  45.19 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.7 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  44.87 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  43.34 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  46.53 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  45.81 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  46.59 
 
 		 378 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  46.53 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  46.53 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  44.28 
 
 		 363 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  46.22 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  44.38 
 
 		 347 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  45.4 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  46.22 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  47.18 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  46.06 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  46.22 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  44.38 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.51 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  41.74 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  45.45 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  46.53 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.23 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  44.28 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  46.53 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  45.92 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  43.22 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  45.62 
 
 		 345 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  45.51 
 
 		 358 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  44.08 
 
 		 347 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  43.22 
 
 		 372 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  44.08 
 
 		 347 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45.88 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>