More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0361 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  100 
 
 		 372 aa  754    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  52.92 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  51.09 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  51.09 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  51.91 
 
 		 387 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  51.64 
 
 		 387 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  53.22 
 
 		 357 aa  373  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  51.64 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  50.82 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  50.55 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  50.27 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  53.39 
 
 		 383 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  53.39 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  51.41 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  49.17 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  50.84 
 
 		 358 aa  342  9e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  47.91 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  46.09 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  48.42 
 
 		 366 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  48.61 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  47.86 
 
 		 432 aa  322  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  47.61 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  48.74 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  48.99 
 
 		 362 aa  319  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  47.86 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  45.75 
 
 		 366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  46.22 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  47.97 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  46.35 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.86 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  45.63 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  49.71 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  47.25 
 
 		 351 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  49.25 
 
 		 352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  47.08 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.79 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  46.18 
 
 		 348 aa  302  5.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  44.51 
 
 		 378 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  45.38 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  44.92 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  43.38 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.4 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  46.53 
 
 		 350 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  44.2 
 
 		 372 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.21 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  44.2 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  44.19 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  44.76 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  45.3 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  43.89 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  44.2 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  46.44 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  48.21 
 
 		 344 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  44.44 
 
 		 358 aa  295  7e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  47.85 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  45.71 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  44.1 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  44.92 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  43.87 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  43.33 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  41.97 
 
 		 374 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  45.71 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  47.02 
 
 		 351 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  47.34 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  43.3 
 
 		 360 aa  292  8e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  43.3 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  42.98 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  45.98 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  47.34 
 
 		 356 aa  289  6e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  42.74 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  44.96 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  42.74 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.1 
 
 		 382 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  46.22 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  45.58 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  44.51 
 
 		 402 aa  286  4e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.08 
 
 		 372 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  43.55 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  45.3 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  45.3 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  45.3 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  45.58 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  46.18 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  45.59 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  46.02 
 
 		 345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  45.58 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  45.68 
 
 		 373 aa  283  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  45.01 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  42.46 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  46.31 
 
 		 357 aa  281  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  45.01 
 
 		 345 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  45.01 
 
 		 345 aa  281  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.94 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  45.01 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  46.61 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  45.01 
 
 		 345 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  42.98 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  45.01 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  42.38 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  45.74 
 
 		 349 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>