More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1305 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  100 
 
 		 402 aa  816    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  59.24 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  62.16 
 
 		 399 aa  486  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  61.99 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  58.11 
 
 		 373 aa  430  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  48.82 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  47.86 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  45.82 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  46.35 
 
 		 427 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  46.35 
 
 		 427 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  46.11 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  46.35 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  49 
 
 		 383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  47.19 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  47.86 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  48.43 
 
 		 383 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  45.56 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.58 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  43.73 
 
 		 358 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  46.89 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  45.01 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  47.18 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  44.13 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  43.63 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.96 
 
 		 349 aa  292  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  41.21 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  44.19 
 
 		 349 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  43.75 
 
 		 375 aa  288  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  43.18 
 
 		 566 aa  288  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  47.16 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  43.9 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  45.35 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.61 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  42.98 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  41.55 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.02 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  42.98 
 
 		 366 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  43.61 
 
 		 362 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  43.23 
 
 		 397 aa  285  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.35 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  44.78 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  42.78 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  45.14 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  40.96 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  40.96 
 
 		 366 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  40.96 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45.83 
 
 		 351 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  45.88 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  42.37 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  43.32 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  40.9 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  41.97 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  46.61 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  43.54 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.15 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.22 
 
 		 347 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  43.15 
 
 		 347 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  42.74 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  41.76 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  43.4 
 
 		 345 aa  279  7e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  41.13 
 
 		 366 aa  279  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  44.08 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  42.41 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  43.7 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  44.16 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  45.45 
 
 		 359 aa  277  3e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  43.4 
 
 		 345 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  42.36 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  44.82 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  43.55 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  43.4 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  43.4 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  39.55 
 
 		 368 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  42.9 
 
 		 362 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.11 
 
 		 349 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  41.76 
 
 		 359 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  43.99 
 
 		 345 aa  276  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  43.4 
 
 		 345 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  43.4 
 
 		 345 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  43.4 
 
 		 345 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  43.4 
 
 		 345 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  43.68 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  43.4 
 
 		 345 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  43.68 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  38.61 
 
 		 361 aa  275  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  42.9 
 
 		 374 aa  275  9e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  41.19 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  40.11 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  45.1 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  44.15 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  43.31 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  42.46 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  43.7 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  42.14 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  43.11 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  43.92 
 
 		 356 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.36 
 
 		 347 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  40.62 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  43.5 
 
 		 372 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  42.69 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>