More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0210 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  100 
 
 
399 aa  813    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  57.89 
 
 
402 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  62.16 
 
 
402 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  63.09 
 
 
398 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  55.46 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.73 
 
 
350 aa  318  9e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  48.04 
 
 
350 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  47.06 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  45.83 
 
 
388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  44.44 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.07 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.72 
 
 
387 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  45.56 
 
 
387 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  44.8 
 
 
375 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  44.81 
 
 
386 aa  298  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  46.43 
 
 
358 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.33 
 
 
360 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  45.22 
 
 
383 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  44.02 
 
 
360 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.18 
 
 
383 aa  296  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  46.9 
 
 
383 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  46.18 
 
 
427 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  44.25 
 
 
360 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  45 
 
 
351 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  46.18 
 
 
427 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  46.18 
 
 
427 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  45.99 
 
 
346 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  45.87 
 
 
346 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  45.99 
 
 
345 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  45.24 
 
 
347 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.67 
 
 
345 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  47.6 
 
 
360 aa  292  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  44.8 
 
 
345 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  45.2 
 
 
357 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.22 
 
 
388 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  44.22 
 
 
345 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  44.8 
 
 
345 aa  290  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.68 
 
 
349 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  46.71 
 
 
351 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  44.22 
 
 
345 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  44.22 
 
 
345 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  44.22 
 
 
345 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  44.31 
 
 
347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  43.93 
 
 
345 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  43.93 
 
 
345 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  43.93 
 
 
345 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  43.93 
 
 
345 aa  289  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  45.38 
 
 
375 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44.19 
 
 
366 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  43.93 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  45.98 
 
 
357 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  44.67 
 
 
352 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  43.64 
 
 
345 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  44.8 
 
 
344 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  44.48 
 
 
366 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  43.6 
 
 
366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  45.21 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  43.71 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  45.24 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  45.92 
 
 
351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  43.06 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  45.95 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.31 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  45.59 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  44.8 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  46.93 
 
 
362 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  44.28 
 
 
358 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  46.71 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  44.05 
 
 
358 aa  282  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.91 
 
 
349 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  44.2 
 
 
347 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  45.02 
 
 
364 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  45.23 
 
 
348 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  43.53 
 
 
345 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  44.31 
 
 
347 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  43.43 
 
 
372 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  43.53 
 
 
366 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  43.57 
 
 
356 aa  279  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  46.11 
 
 
339 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.45 
 
 
344 aa  279  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.45 
 
 
344 aa  278  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  42.44 
 
 
365 aa  278  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  44.25 
 
 
345 aa  278  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  42.44 
 
 
351 aa  278  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  43.24 
 
 
366 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  45.26 
 
 
344 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  43.24 
 
 
366 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1695  twitching motility protein  43.28 
 
 
360 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.34 
 
 
344 aa  276  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  42.51 
 
 
345 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  44.61 
 
 
347 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  44.82 
 
 
345 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  42.12 
 
 
358 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  43.6 
 
 
382 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  40.73 
 
 
363 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  43.24 
 
 
368 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  42.17 
 
 
359 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  43.5 
 
 
366 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  44.67 
 
 
365 aa  275  7e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  42.53 
 
 
372 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>