More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1584 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  100 
 
 
373 aa  761    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1661  twitching mobility protein  65.95 
 
 
402 aa  497  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.423515  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  58.11 
 
 
402 aa  430  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0210  twitching motility protein  55.46 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0964904  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  54.35 
 
 
398 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  47.37 
 
 
427 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  47.37 
 
 
437 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  47.09 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  47.09 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  46.22 
 
 
383 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  48.25 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  46.59 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  46.41 
 
 
387 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  44.78 
 
 
387 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  48.55 
 
 
383 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  47.98 
 
 
383 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  46.36 
 
 
350 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  46.06 
 
 
350 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  46.9 
 
 
388 aa  295  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  46.39 
 
 
345 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  46.49 
 
 
386 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.15 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  42.77 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  42.17 
 
 
366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  45.68 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  45.56 
 
 
358 aa  281  9e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  44.51 
 
 
375 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  44.01 
 
 
351 aa  279  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.05 
 
 
349 aa  278  8e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  43.44 
 
 
362 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  42.82 
 
 
358 aa  278  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  45.35 
 
 
356 aa  276  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  43.33 
 
 
356 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  45.35 
 
 
358 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  40.66 
 
 
375 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.9 
 
 
360 aa  275  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  43.88 
 
 
352 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.08 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  43.88 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  42.53 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  44.92 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  45.35 
 
 
356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  44.9 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  46.23 
 
 
344 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  44.55 
 
 
347 aa  272  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  45.09 
 
 
357 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  46.08 
 
 
344 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  44.48 
 
 
347 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  43.32 
 
 
347 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  44.82 
 
 
344 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  44.82 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  45.35 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  45.12 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  42.81 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  41.74 
 
 
365 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  43.16 
 
 
345 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  44.85 
 
 
347 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  44.68 
 
 
358 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  43.77 
 
 
345 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  43.77 
 
 
345 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  43.77 
 
 
345 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  44.14 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  43.2 
 
 
368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  44.79 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  44.04 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  43.47 
 
 
345 aa  268  8e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.98 
 
 
351 aa  269  8e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  43.77 
 
 
345 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  43.2 
 
 
344 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  45.71 
 
 
356 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  43.77 
 
 
345 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0871  putative protein transport, PilT-like  43.66 
 
 
378 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  44.85 
 
 
347 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.16 
 
 
349 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  43.75 
 
 
345 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  43.2 
 
 
344 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  43.47 
 
 
345 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  43.37 
 
 
345 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  43.16 
 
 
345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  43.37 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.64 
 
 
347 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  42.9 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  43.16 
 
 
345 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  43.16 
 
 
345 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  43.16 
 
 
345 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  44.41 
 
 
374 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  42.9 
 
 
372 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  45.02 
 
 
344 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  44.07 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  43.6 
 
 
349 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  40.52 
 
 
366 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.33 
 
 
366 aa  265  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  42.3 
 
 
370 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  40.8 
 
 
366 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  44.17 
 
 
356 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  40.53 
 
 
348 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  45.95 
 
 
356 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  44.48 
 
 
356 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  43.5 
 
 
351 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  43.39 
 
 
359 aa  264  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>