More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2561 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  100 
 
 
352 aa  722    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  78.57 
 
 
351 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  60.18 
 
 
347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  55.56 
 
 
344 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  56.6 
 
 
349 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  58.57 
 
 
339 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  57.18 
 
 
360 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  56.85 
 
 
351 aa  378  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  53.55 
 
 
351 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  52.08 
 
 
351 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  55.52 
 
 
350 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  55.22 
 
 
350 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  52.68 
 
 
365 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  54.97 
 
 
348 aa  362  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  52.38 
 
 
350 aa  361  8e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  55.59 
 
 
360 aa  358  6e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  53.03 
 
 
363 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  52.42 
 
 
360 aa  350  3e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  55.52 
 
 
360 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  51.64 
 
 
360 aa  348  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  52.08 
 
 
350 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  52.08 
 
 
356 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  51.93 
 
 
360 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  49.85 
 
 
374 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.84 
 
 
347 aa  344  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  51.69 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  51.69 
 
 
368 aa  342  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  52.57 
 
 
382 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  51.93 
 
 
360 aa  341  9e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  47.8 
 
 
372 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  52.25 
 
 
372 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  50.3 
 
 
347 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  49.27 
 
 
362 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  51.67 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  51.83 
 
 
367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  48.49 
 
 
372 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  52.45 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  50 
 
 
372 aa  335  9e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.17 
 
 
365 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  46.76 
 
 
374 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.26 
 
 
347 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  47.92 
 
 
372 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  47.92 
 
 
372 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  50.61 
 
 
375 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.67 
 
 
347 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.67 
 
 
347 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  332  5e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  51.86 
 
 
365 aa  332  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  51.84 
 
 
358 aa  332  8e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  50.46 
 
 
347 aa  332  8e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  50 
 
 
363 aa  332  9e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  53.05 
 
 
403 aa  331  9e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  49.85 
 
 
345 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  50.6 
 
 
365 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.58 
 
 
347 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  51.25 
 
 
366 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  50 
 
 
345 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  51.25 
 
 
366 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50 
 
 
344 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  47.9 
 
 
358 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  51.25 
 
 
366 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  49.86 
 
 
369 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  50.77 
 
 
357 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.39 
 
 
344 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  51.23 
 
 
358 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  49.23 
 
 
347 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  49.7 
 
 
368 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  53.05 
 
 
362 aa  329  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  50.3 
 
 
365 aa  328  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  51.39 
 
 
344 aa  328  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 
344 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  49.7 
 
 
344 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  49.39 
 
 
347 aa  328  8e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 
344 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  47.01 
 
 
346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  49.23 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  48.81 
 
 
345 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  49.41 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  50.16 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  50.15 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  49.85 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  49.85 
 
 
356 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  47.13 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.39 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  49.54 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  48.09 
 
 
358 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  51.36 
 
 
362 aa  325  7e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  49.54 
 
 
347 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  48.92 
 
 
347 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  48.92 
 
 
347 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  49.23 
 
 
347 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  48.38 
 
 
357 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  49.39 
 
 
344 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  49.24 
 
 
345 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  48.82 
 
 
350 aa  324  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  50.45 
 
 
366 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  49.54 
 
 
347 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  49.7 
 
 
344 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>