More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1130 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  100 
 
 		 366 aa  729    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  66.57 
 
 		 356 aa  478  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  64.12 
 
 		 396 aa  447  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  59.49 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  59.49 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  59.77 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  52.29 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  53.09 
 
 		 375 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  52.26 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  51.4 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  50.71 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  51.54 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  51.54 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  51.54 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  52.12 
 
 		 383 aa  345  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  48.74 
 
 		 383 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  49.86 
 
 		 386 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  49.15 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  49.02 
 
 		 387 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  49.86 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  48.74 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  48.3 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  48.86 
 
 		 383 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  48.61 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.43 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  45.75 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  46.73 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  47.54 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  47.59 
 
 		 344 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  47.16 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  45.22 
 
 		 375 aa  309  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.1 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  46.22 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  46.55 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  46.04 
 
 		 360 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  44.83 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  45.54 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  42.12 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  43.03 
 
 		 358 aa  301  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  46.27 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  45.43 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  45.33 
 
 		 365 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  43.47 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  42.58 
 
 		 398 aa  300  2e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  49.04 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.37 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  44.9 
 
 		 358 aa  300  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  41.83 
 
 		 356 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  42.12 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  44.12 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  43.52 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  43.1 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  44.76 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  44.51 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  43.75 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  43.82 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  43.82 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  47.83 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  47.83 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  47.11 
 
 		 566 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.96 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  43.75 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  42.54 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  47.52 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  42.17 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  43.84 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  47.4 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  47.06 
 
 		 370 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  42.45 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  43.1 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  44.61 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  43.64 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  44.41 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.62 
 
 		 347 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  44.41 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  42.94 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  43.06 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  43.06 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  41.76 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  41.88 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  44.24 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  45.94 
 
 		 347 aa  289  5.0000000000000004e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  47.66 
 
 		 365 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  45.83 
 
 		 368 aa  288  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.48 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  41.27 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  45.83 
 
 		 344 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  43.03 
 
 		 351 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  40.46 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  48.53 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  48.92 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  39.94 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.83 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  43.92 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  43.32 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  40.74 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  42.94 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  46.88 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  41.91 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  43.03 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>