More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2271 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  756    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  99.2 
 
 
373 aa  753    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  61.19 
 
 
364 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  55.1 
 
 
384 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  58.29 
 
 
409 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  55.81 
 
 
377 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  56.74 
 
 
381 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  55.97 
 
 
375 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  59.43 
 
 
377 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  54.64 
 
 
380 aa  424  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  55.28 
 
 
402 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  51.23 
 
 
376 aa  425  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  52.8 
 
 
382 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  57.38 
 
 
388 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  52.53 
 
 
387 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  55.81 
 
 
378 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  54.24 
 
 
373 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  55.43 
 
 
397 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  56.09 
 
 
387 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  55.52 
 
 
389 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  56.66 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  53.54 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  55.49 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  57.51 
 
 
378 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  53.82 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  56 
 
 
375 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  52.97 
 
 
376 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  55.65 
 
 
381 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  56.56 
 
 
376 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  54.39 
 
 
378 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  54.11 
 
 
378 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  56.56 
 
 
376 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  53.93 
 
 
376 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  53.69 
 
 
370 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  55.08 
 
 
372 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  53.65 
 
 
376 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  56.16 
 
 
379 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  54.42 
 
 
372 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  53.82 
 
 
378 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  54.67 
 
 
378 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  54.13 
 
 
370 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  55.14 
 
 
390 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  53.26 
 
 
378 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  54.42 
 
 
370 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  53.82 
 
 
378 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  54.67 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  53.82 
 
 
379 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  54.24 
 
 
385 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  54.11 
 
 
379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  53.28 
 
 
370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  52.71 
 
 
370 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  52.42 
 
 
370 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  57.43 
 
 
378 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  52.69 
 
 
378 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  53.82 
 
 
378 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  52.72 
 
 
378 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  52.99 
 
 
370 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  52.99 
 
 
370 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  53.11 
 
 
379 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  52.71 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  52.71 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  53.06 
 
 
370 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  52.71 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  52.71 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  52.71 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  52.42 
 
 
370 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  51.8 
 
 
395 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  52.79 
 
 
372 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  51.28 
 
 
370 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  50.28 
 
 
370 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  52.14 
 
 
375 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  54.57 
 
 
390 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  52.34 
 
 
373 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  54.91 
 
 
378 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  52.17 
 
 
390 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  51.79 
 
 
373 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  50.29 
 
 
370 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  47.03 
 
 
368 aa  352  7e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  48.29 
 
 
368 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  49.42 
 
 
387 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  49.42 
 
 
387 aa  348  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  50 
 
 
401 aa  348  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  48.11 
 
 
388 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  48.04 
 
 
368 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  49.56 
 
 
389 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  48.04 
 
 
368 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  46.28 
 
 
380 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  48.84 
 
 
387 aa  338  5.9999999999999996e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  45.05 
 
 
382 aa  338  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  48.96 
 
 
371 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  46.98 
 
 
395 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  48.82 
 
 
392 aa  325  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  46.8 
 
 
349 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  46.75 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  44.03 
 
 
386 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  44.32 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  43.47 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.32 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.18 
 
 
368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  43.9 
 
 
347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>