More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2517 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  100 
 
 		 404 aa  822    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  70.87 
 
 		 392 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  62.43 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  62.53 
 
 		 401 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  62.2 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  58.59 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  58.59 
 
 		 387 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  61.7 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  60 
 
 		 388 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  57.82 
 
 		 382 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  58.22 
 
 		 389 aa  451  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  50.65 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  50.38 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  46.55 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  46.2 
 
 		 377 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  47.75 
 
 		 381 aa  328  9e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  47.4 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  45.16 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  47.81 
 
 		 376 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  47.81 
 
 		 376 aa  323  4e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  47.04 
 
 		 373 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  43.85 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  45.45 
 
 		 378 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  46.44 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  46.75 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  45.35 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  46.36 
 
 		 382 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  44.72 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  45.92 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  45.4 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  45.71 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  44.57 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  46.8 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  44.54 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  44.72 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  46.36 
 
 		 380 aa  316  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  45.95 
 
 		 372 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  43.26 
 
 		 381 aa  313  4.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  43.06 
 
 		 385 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  43.77 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  45.24 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  43.58 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  44.73 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  44.44 
 
 		 378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  43.58 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  44 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  43.45 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  45.3 
 
 		 378 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  44.97 
 
 		 378 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  42.08 
 
 		 375 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  43.02 
 
 		 378 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  44.44 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  44.47 
 
 		 385 aa  306  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  44.06 
 
 		 378 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  43.86 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  43.06 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  43.7 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  43.02 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  43.01 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  42.33 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  42.86 
 
 		 375 aa  300  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  42.7 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  44.66 
 
 		 378 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  41.94 
 
 		 391 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  41.03 
 
 		 376 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  42.21 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  41.88 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  42.7 
 
 		 373 aa  293  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  41.03 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  42.65 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  41.11 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  42.12 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  42.12 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  42.12 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  42.35 
 
 		 370 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  41.36 
 
 		 370 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  40.85 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  41.36 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  41.36 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  41.76 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  41.08 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  43.31 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  43.59 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  42.06 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  43.63 
 
 		 372 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  41.08 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  42.82 
 
 		 378 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  41.98 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  44.8 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  40.29 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  42.57 
 
 		 368 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  41.31 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  41.71 
 
 		 437 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  40.74 
 
 		 368 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  41.94 
 
 		 375 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  39.43 
 
 		 387 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  42 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  38.1 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  41.43 
 
 		 427 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  41.11 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>