More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1334 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  88.92 
 
 		 370 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  90.27 
 
 		 370 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  90.54 
 
 		 370 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  90.27 
 
 		 370 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  90 
 
 		 370 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  91.35 
 
 		 370 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  90.54 
 
 		 370 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  90.54 
 
 		 370 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  89.19 
 
 		 370 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  100 
 
 		 370 aa  761    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  88.92 
 
 		 370 aa  684    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  88.11 
 
 		 370 aa  676    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  89.73 
 
 		 370 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  89.73 
 
 		 370 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  89.73 
 
 		 370 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  67.66 
 
 		 375 aa  524  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  64.11 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  62.43 
 
 		 370 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  63.01 
 
 		 373 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  61.56 
 
 		 381 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  62.15 
 
 		 385 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  59.57 
 
 		 387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  61.47 
 
 		 380 aa  464  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  59.3 
 
 		 382 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  59.5 
 
 		 377 aa  457  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  62.46 
 
 		 372 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  58.38 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  57.3 
 
 		 368 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  60.11 
 
 		 405 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  59.17 
 
 		 388 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  58.11 
 
 		 368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  58.97 
 
 		 376 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  57.26 
 
 		 373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  58.01 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  56.68 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  57.46 
 
 		 379 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  57.46 
 
 		 379 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  59.14 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  58.97 
 
 		 381 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2855  type II secretion system protein E  88.33 
 
 		 247 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000216889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  56.91 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  55.91 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  59.17 
 
 		 378 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  60.4 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  57.3 
 
 		 372 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  56.62 
 
 		 390 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  57.55 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  56.35 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  55.49 
 
 		 376 aa  425  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  55.68 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  55.14 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  55.52 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  57.18 
 
 		 381 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  56.63 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  56.35 
 
 		 378 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  54.7 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  57.26 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  54.7 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  54.97 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  53.59 
 
 		 378 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  54.42 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  54.42 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  55.27 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  54.26 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  54.26 
 
 		 376 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  55.83 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  54.6 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  54.91 
 
 		 397 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  54.96 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  53.64 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  54.99 
 
 		 409 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  50.43 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  50.7 
 
 		 377 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  51.44 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  53.78 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  49.72 
 
 		 364 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  51.12 
 
 		 375 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  49.3 
 
 		 375 aa  358  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  48.41 
 
 		 372 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  44.94 
 
 		 390 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  48.39 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  47.08 
 
 		 395 aa  328  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  45.17 
 
 		 376 aa  322  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  45.95 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  44.66 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  44.41 
 
 		 382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  45 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  45.88 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  46.18 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  44.75 
 
 		 383 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  44.48 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  43.53 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  44.71 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  44.71 
 
 		 387 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  44.26 
 
 		 386 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  42.18 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  43.18 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  42.12 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  46.49 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  45.29 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>