More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3082 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  100 
 
 		 370 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  74.28 
 
 		 389 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  73.49 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  76.57 
 
 		 409 aa  557  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  66.3 
 
 		 375 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  67.82 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  64.38 
 
 		 390 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  57.14 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  57.42 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  55.14 
 
 		 381 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  56.21 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  56.65 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  56.04 
 
 		 378 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  55.08 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  56.04 
 
 		 378 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  55.37 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  54.95 
 
 		 378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  56.09 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  52.26 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  52.26 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  53.85 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  52.29 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  54.95 
 
 		 378 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  56.09 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  55.33 
 
 		 378 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  53.02 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  53.72 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  54.96 
 
 		 378 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  54.06 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  50.95 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  54.73 
 
 		 379 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  50.81 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  55.94 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  53.44 
 
 		 378 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  53.67 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  50.81 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  54.25 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  56.65 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  54.4 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  51.53 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  52.66 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  50.68 
 
 		 376 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  54.27 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  53.39 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  51.37 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  51.25 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  53.66 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  53.66 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  53.66 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  53.12 
 
 		 370 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  54.13 
 
 		 370 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  54.26 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  51.1 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  51.98 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  50.27 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  50.86 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  55.46 
 
 		 387 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  54.26 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  50.14 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  53.22 
 
 		 370 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  54.26 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  54.55 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  54.26 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  51.94 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  54.05 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  53.22 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  52.59 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  49.86 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  53.49 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  51 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  52.31 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  52.15 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  50.28 
 
 		 373 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  51.88 
 
 		 376 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  51.42 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  51.14 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  49.45 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  49.15 
 
 		 373 aa  352  5e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 		 395 aa  352  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  48.84 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  49.86 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  47.26 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  48.48 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  47.26 
 
 		 387 aa  339  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  45.82 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  47.14 
 
 		 371 aa  328  8e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  47.84 
 
 		 388 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  44.67 
 
 		 382 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  45.24 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  45.53 
 
 		 387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  45.53 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  45 
 
 		 392 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  47.44 
 
 		 358 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  43.52 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  42.48 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  43.47 
 
 		 387 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  43.75 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  42.11 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  42.37 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.5 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>