More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2195 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  100 
 
 
390 aa  805    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  65.89 
 
 
395 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  51.94 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  51.94 
 
 
387 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  55.46 
 
 
387 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  53.74 
 
 
401 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  50.39 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  52.58 
 
 
392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  54.15 
 
 
382 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  50.39 
 
 
395 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  55.46 
 
 
389 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  53.3 
 
 
402 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  55.33 
 
 
364 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  51.3 
 
 
388 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  53.71 
 
 
373 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  54.57 
 
 
373 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  50.65 
 
 
404 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  52.16 
 
 
387 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  48.31 
 
 
390 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  54.87 
 
 
377 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  53.69 
 
 
375 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  49.57 
 
 
372 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  49.72 
 
 
397 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  48 
 
 
373 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  51.16 
 
 
389 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  49.43 
 
 
381 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  50.86 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  50.87 
 
 
391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  48.43 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  49.43 
 
 
378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  50.72 
 
 
377 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  48 
 
 
380 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  48.31 
 
 
370 aa  352  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  45.43 
 
 
375 aa  352  5.9999999999999994e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  50.29 
 
 
390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  50 
 
 
381 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  48.7 
 
 
370 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  49.29 
 
 
378 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  48.99 
 
 
370 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  48.99 
 
 
370 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  48.99 
 
 
370 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  48.41 
 
 
370 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  48.41 
 
 
370 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  47.22 
 
 
376 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  47.22 
 
 
376 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  47.43 
 
 
387 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  50.44 
 
 
390 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  47.43 
 
 
382 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  48.41 
 
 
370 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  50.14 
 
 
378 aa  349  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  48.41 
 
 
370 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  45.36 
 
 
385 aa  349  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  46.35 
 
 
370 aa  349  5e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  49.28 
 
 
378 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  48.41 
 
 
370 aa  348  8e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  48.21 
 
 
381 aa  348  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  50.14 
 
 
379 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  48.14 
 
 
378 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  49 
 
 
378 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  48.71 
 
 
378 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  47.28 
 
 
370 aa  346  5e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  49.86 
 
 
379 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  49.71 
 
 
388 aa  345  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  48.14 
 
 
378 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  47.97 
 
 
375 aa  345  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  47.26 
 
 
378 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  48.86 
 
 
372 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  48.69 
 
 
370 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  46.72 
 
 
405 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  44.94 
 
 
370 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  48.16 
 
 
370 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  48.31 
 
 
379 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  47.25 
 
 
370 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  48.57 
 
 
378 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  48.82 
 
 
376 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  46.38 
 
 
370 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  47.78 
 
 
378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  48.97 
 
 
409 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  48.06 
 
 
378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  49.42 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  45.58 
 
 
376 aa  335  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  48.4 
 
 
384 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  46.9 
 
 
376 aa  333  3e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  46.9 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  44.9 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  46 
 
 
373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  47.95 
 
 
368 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  45.43 
 
 
373 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  44.44 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  44.57 
 
 
368 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  45.38 
 
 
368 aa  309  5e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  46.06 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.44 
 
 
437 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  43.77 
 
 
371 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  43.89 
 
 
427 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  43.33 
 
 
427 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  43.33 
 
 
427 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  44.57 
 
 
366 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  44.57 
 
 
366 aa  293  4e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  41.67 
 
 
387 aa  292  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>