More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2045 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  100 
 
 		 395 aa  809    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  75.65 
 
 		 401 aa  597  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  72.06 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  73.68 
 
 		 380 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  72.06 
 
 		 387 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  72.85 
 
 		 387 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  69.11 
 
 		 388 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  68.13 
 
 		 389 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  67.54 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  65.62 
 
 		 392 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  61.7 
 
 		 404 aa  472  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  53.6 
 
 		 395 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  50.39 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  45.26 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  50 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  49.13 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  49.13 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  46.98 
 
 		 373 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  48.4 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  48.55 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  46.98 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  47.41 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  46.51 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  48.26 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  47.8 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  46.96 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  47.83 
 
 		 378 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  46.69 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  47.14 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  46.59 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  48.56 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  47.28 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  48.24 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  46.89 
 
 		 379 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  46.97 
 
 		 397 aa  332  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  46.89 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  48.41 
 
 		 378 aa  332  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  45.68 
 
 		 373 aa  332  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  48.12 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  48.12 
 
 		 378 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  45.53 
 
 		 385 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  46.94 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  45.43 
 
 		 381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  48 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  48.7 
 
 		 378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  44.03 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  45.48 
 
 		 381 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  44.53 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  45.45 
 
 		 370 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  44.84 
 
 		 378 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  46.06 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  46.67 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  46.33 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  46 
 
 		 378 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  46.26 
 
 		 385 aa  322  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  44.88 
 
 		 390 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  47.46 
 
 		 378 aa  322  8e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  45.58 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  46.13 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  45.71 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  47.41 
 
 		 378 aa  315  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  43.48 
 
 		 376 aa  315  9e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  43.94 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  42.9 
 
 		 376 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  45.22 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  45.51 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  43.97 
 
 		 370 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  43.97 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  43.97 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  43.97 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  45.29 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  43.75 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  43.97 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  43.68 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  43.68 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  43.68 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  43.68 
 
 		 370 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  43.84 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  43.8 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  43.82 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  43.84 
 
 		 373 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  44.02 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  44 
 
 		 370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  45.11 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  43.23 
 
 		 370 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  45.11 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  44.25 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  44.54 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  43.27 
 
 		 373 aa  299  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  41.43 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  46.04 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  44.87 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  45.09 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  44.44 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  40.57 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  40.57 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  40.57 
 
 		 427 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  39.71 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  42.49 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  39.44 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>