More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0343 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  100 
 
 
385 aa  798    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  69.25 
 
 
382 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  68.99 
 
 
387 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  69.21 
 
 
381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  67.65 
 
 
376 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  67.11 
 
 
373 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  67.37 
 
 
380 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  68.19 
 
 
405 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  69.86 
 
 
372 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  62.05 
 
 
376 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  60.32 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  62.73 
 
 
388 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  61.83 
 
 
373 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  62.94 
 
 
379 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  60.75 
 
 
373 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  61.85 
 
 
379 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  60.93 
 
 
370 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  62.13 
 
 
379 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  60.38 
 
 
370 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  61.62 
 
 
379 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  62.15 
 
 
370 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  60.66 
 
 
370 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  474  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  61.76 
 
 
372 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  60.66 
 
 
370 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  62.39 
 
 
370 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  59.36 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  62.11 
 
 
370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  60.49 
 
 
378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  61.35 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  61.54 
 
 
370 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  58.11 
 
 
378 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  59.62 
 
 
378 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  60.56 
 
 
381 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  59.19 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  58.92 
 
 
378 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  58.65 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  61.96 
 
 
377 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  58.92 
 
 
378 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  64.84 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  58.11 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  58.31 
 
 
378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  60.11 
 
 
370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  58.92 
 
 
378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  56.94 
 
 
370 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  56.49 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  55.46 
 
 
375 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  57.26 
 
 
370 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  60.96 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  59.1 
 
 
368 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  59.38 
 
 
368 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  54.84 
 
 
385 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  55.79 
 
 
390 aa  429  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  57.76 
 
 
376 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  57.76 
 
 
376 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  57.67 
 
 
409 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  57.55 
 
 
390 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  53.85 
 
 
391 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  54.82 
 
 
368 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  53.82 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  53.82 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  52.82 
 
 
389 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  55.43 
 
 
368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  51.61 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  52.25 
 
 
397 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  53.26 
 
 
384 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  53.72 
 
 
370 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  53.12 
 
 
371 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  50.55 
 
 
377 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  51.12 
 
 
375 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  49.57 
 
 
364 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  48.13 
 
 
402 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  48.9 
 
 
376 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  48.12 
 
 
372 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  46.74 
 
 
387 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  45.36 
 
 
390 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  45.35 
 
 
395 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  45.83 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  47.32 
 
 
401 aa  329  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  46.44 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.28 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  47.18 
 
 
389 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  46.31 
 
 
388 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  44.1 
 
 
387 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  44.1 
 
 
387 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  44.96 
 
 
388 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  45.53 
 
 
395 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  43.12 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  44.64 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2855  type II secretion system protein E  63.52 
 
 
247 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000216889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.86 
 
 
387 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2517  twitching motility protein  44.41 
 
 
404 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0242978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  45.43 
 
 
388 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  45.22 
 
 
366 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  44.57 
 
 
358 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>