More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1222 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  100 
 
 
376 aa  779    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  98.14 
 
 
376 aa  764    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  74.06 
 
 
405 aa  607  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  73.33 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  60.32 
 
 
385 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  59.62 
 
 
387 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  59.89 
 
 
382 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  58.82 
 
 
381 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  60.11 
 
 
380 aa  481  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  59.14 
 
 
373 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  58.22 
 
 
372 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  59.56 
 
 
378 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  58.65 
 
 
373 aa  455  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  60.34 
 
 
388 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  57.66 
 
 
378 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  57.03 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  57.34 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  57.63 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  55.99 
 
 
378 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  55.62 
 
 
378 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  59.21 
 
 
378 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  56.06 
 
 
378 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  55.34 
 
 
379 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  55.43 
 
 
378 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  54.79 
 
 
379 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  53.83 
 
 
378 aa  431  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  57.38 
 
 
370 aa  431  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  57.23 
 
 
379 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  56.94 
 
 
381 aa  428  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  57.42 
 
 
372 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  55.91 
 
 
378 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  56.94 
 
 
370 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  56.94 
 
 
370 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  56.94 
 
 
370 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  56.66 
 
 
370 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  55.49 
 
 
370 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  55.49 
 
 
370 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  56.94 
 
 
381 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  56.66 
 
 
370 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  56.36 
 
 
379 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  56.66 
 
 
370 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  53.55 
 
 
377 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  56.66 
 
 
370 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  56.66 
 
 
370 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  56.82 
 
 
370 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  56.66 
 
 
370 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  53.11 
 
 
378 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  55.78 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  53.85 
 
 
375 aa  415  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  56.94 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  54.7 
 
 
409 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  54.99 
 
 
370 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  53.65 
 
 
373 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  54.32 
 
 
370 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  55.24 
 
 
370 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  53.52 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  53.01 
 
 
385 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  52.08 
 
 
397 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  55.4 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  52.42 
 
 
391 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  51.8 
 
 
389 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  54.47 
 
 
378 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  53.07 
 
 
370 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  50.28 
 
 
375 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  51.84 
 
 
376 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  51.84 
 
 
376 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  51.25 
 
 
368 aa  381  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  50.97 
 
 
368 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  52.48 
 
 
370 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  52 
 
 
371 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  49.04 
 
 
402 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  50.56 
 
 
368 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  49.86 
 
 
384 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  49.01 
 
 
364 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  50 
 
 
368 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  47.49 
 
 
375 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  48.44 
 
 
377 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  47.22 
 
 
372 aa  357  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  46.65 
 
 
395 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  46.9 
 
 
390 aa  332  7.000000000000001e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  46.72 
 
 
387 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  43.34 
 
 
376 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  43.77 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  43.77 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  44.67 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  43.48 
 
 
389 aa  311  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  41.16 
 
 
401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  42.61 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  42.78 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  44.35 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  42.05 
 
 
386 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  44.35 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  42.86 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  45.18 
 
 
370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  41.88 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  39.94 
 
 
366 aa  302  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  40.61 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  42.9 
 
 
395 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  42.03 
 
 
427 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  42.03 
 
 
427 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>