More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3882 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  100 
 
 		 378 aa  780    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  76.72 
 
 		 378 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  77.75 
 
 		 377 aa  617  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  75.66 
 
 		 378 aa  607  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  74.6 
 
 		 378 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  75.4 
 
 		 378 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  74.34 
 
 		 378 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  75.13 
 
 		 378 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  72.75 
 
 		 378 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  73.28 
 
 		 378 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  73.28 
 
 		 378 aa  595  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  73.28 
 
 		 378 aa  593  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  73.54 
 
 		 378 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  78.04 
 
 		 378 aa  593  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  70.82 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  69.58 
 
 		 379 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  69.31 
 
 		 379 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  69.84 
 
 		 379 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  67.2 
 
 		 379 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  66.93 
 
 		 381 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  67.9 
 
 		 390 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  64.38 
 
 		 390 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  64.72 
 
 		 381 aa  513  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  64.56 
 
 		 381 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  63.34 
 
 		 373 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  64.84 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  61.64 
 
 		 405 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  63.86 
 
 		 382 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  61.48 
 
 		 376 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  62.74 
 
 		 380 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  64.84 
 
 		 385 aa  475  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  63.06 
 
 		 372 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  61.64 
 
 		 373 aa  458  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  59.17 
 
 		 370 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  59.17 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  58.61 
 
 		 370 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  59.49 
 
 		 376 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  58.61 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  59.21 
 
 		 376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  58.89 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  58.89 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  59.17 
 
 		 370 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  59.17 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  59.17 
 
 		 370 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  59.17 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  58.61 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  58.61 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  58.61 
 
 		 370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  60.55 
 
 		 373 aa  448  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  60.12 
 
 		 370 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  58.33 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  58.69 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  58.69 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  59.25 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  58.2 
 
 		 372 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  61.13 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  57.22 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  59.14 
 
 		 409 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  57.26 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  59.42 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  57.54 
 
 		 391 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  57.43 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  56.7 
 
 		 373 aa  418  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  57.22 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  56.52 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  53.37 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  54.47 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  56.64 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  54.37 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  54.83 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  54.37 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  54.55 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  53.37 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  53.74 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  49.72 
 
 		 371 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  53.09 
 
 		 368 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  51.14 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  50.72 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  50 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  49.42 
 
 		 390 aa  355  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  49.13 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  48.7 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  49.57 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  49.29 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  49.29 
 
 		 387 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  49.29 
 
 		 388 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  45.9 
 
 		 382 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  46.37 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  45.65 
 
 		 401 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  47.41 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  47.11 
 
 		 368 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  45.88 
 
 		 387 aa  319  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  47.99 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  43.71 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  45.76 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  43.49 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  44 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  44.54 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  45.14 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  45.4 
 
 		 380 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>