More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4442 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  100 
 
 		 376 aa  761    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  51.23 
 
 		 373 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  51.5 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  54.15 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  53.19 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  52.02 
 
 		 387 aa  388  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  52.72 
 
 		 377 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  50.84 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  52.42 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  53.01 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  50 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  52.81 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  49.86 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  48.07 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  50.43 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  50.42 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  52.17 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  51.88 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  50.58 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  48.9 
 
 		 385 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  50.28 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  50.58 
 
 		 388 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  51.3 
 
 		 378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  49.71 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  49.71 
 
 		 376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  50.56 
 
 		 390 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  49.72 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  50.29 
 
 		 381 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  51.16 
 
 		 378 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  49.72 
 
 		 379 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  50.43 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  50.43 
 
 		 378 aa  355  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  49.44 
 
 		 379 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  50.72 
 
 		 381 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  48.87 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  49.42 
 
 		 378 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  52.1 
 
 		 370 aa  352  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  49.41 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  49.17 
 
 		 378 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  47.03 
 
 		 405 aa  349  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  48.99 
 
 		 373 aa  349  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  49.13 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  48.41 
 
 		 381 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  47.79 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  48.07 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  48.29 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  48.12 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  45.89 
 
 		 376 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  48.82 
 
 		 390 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  44.19 
 
 		 376 aa  338  7e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  48.69 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  47.25 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  47.69 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  48.7 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  43.34 
 
 		 376 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  46.67 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  45.43 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  45.01 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  44.6 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  44.6 
 
 		 370 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  45.17 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  44.6 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  44.6 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  45.58 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  44.44 
 
 		 370 aa  322  6e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  45.58 
 
 		 370 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  45.95 
 
 		 370 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  44.44 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  44.44 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  44.44 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  44.38 
 
 		 370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  44.48 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  44.16 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  46.84 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  45.66 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  44.6 
 
 		 388 aa  316  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  44.93 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  47.28 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  43.49 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  43.49 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  45.77 
 
 		 389 aa  312  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  45.58 
 
 		 373 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  45.01 
 
 		 373 aa  308  8e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  44.32 
 
 		 368 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  44.57 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  43.63 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  44.79 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  42.86 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  43.73 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  45.48 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  41.26 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1805  hypothetical protein  44.31 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00695665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  42.61 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  43.6 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  41.43 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.64 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  40.29 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  44.81 
 
 		 383 aa  281  9e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  43.62 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  43.49 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>