More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2855 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2855  type II secretion system protein E  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000216889  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2685  twitching motility protein  91.67 
 
 		 370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1139  twitching motility protein  90.83 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0768436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3023  twitching motility protein  91.67 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000138917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3350  twitching motility protein PilU  91.25 
 
 		 370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3038  twitching motility protein  91.67 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3181  twitching motility protein  91.67 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  normal  0.0177066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1340  twitching motility protein  91.67 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0289531  hitchhiker  0.0000000718635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1195  twitching motility protein  91.25 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1266  twitching motility protein  91.25 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1196  twitching motility protein  91.25 
 
 		 370 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0761458  normal  0.595068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2680  twitching motility protein  88.75 
 
 		 370 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.595329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1334  twitching motility protein  88.33 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  87.92 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2475  twitching motility protein PilU  86.25 
 
 		 370 aa  434  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.770515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1129  twitching motility protein  87.92 
 
 		 370 aa  428  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3661  twitching motility protein PilU  71.85 
 
 		 375 aa  356  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03296  twitching motility protein PilU (type IV pili)  67.08 
 
 		 370 aa  343  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3716  twitching motility protein  67.37 
 
 		 370 aa  339  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  70.51 
 
 		 380 aa  332  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  71.43 
 
 		 373 aa  332  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0545  twitching motility protein PilU, type II/IV secretion system protein  62.71 
 
 		 368 aa  332  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0015  twitching motility protein PilU  63.56 
 
 		 368 aa  328  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03576  hypothetical protein  63.14 
 
 		 368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002459  type IV pilus (Tfp) assembly protein ATPase component PilU  63.14 
 
 		 368 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  64.56 
 
 		 387 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  64.56 
 
 		 382 aa  324  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  69.59 
 
 		 381 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3038  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilU)  63.87 
 
 		 371 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  64.68 
 
 		 377 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  67.74 
 
 		 372 aa  316  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0292  twitching motility protein  62.45 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  63.52 
 
 		 385 aa  312  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  61.28 
 
 		 388 aa  311  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  63.04 
 
 		 378 aa  305  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0266  putative twitching motility protein PilU  61.18 
 
 		 373 aa  305  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1842  twitching motility protein  65.9 
 
 		 381 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236681  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  62.61 
 
 		 378 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  64 
 
 		 378 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  63.56 
 
 		 378 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3882  pilus retraction protein PilT  63.88 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  65.44 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  62.83 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0313  twitching motility protein  61.51 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  64.35 
 
 		 378 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  64.29 
 
 		 378 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  62.67 
 
 		 379 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  64.98 
 
 		 379 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  64.06 
 
 		 405 aa  300  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  63.84 
 
 		 378 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  62.22 
 
 		 379 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  64.52 
 
 		 378 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2413  twitching motility protein  58.61 
 
 		 390 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2935  twitching motility protein  64.98 
 
 		 381 aa  299  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  61.78 
 
 		 378 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  60.43 
 
 		 376 aa  298  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  64 
 
 		 378 aa  294  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3052  twitching motility protein  56.68 
 
 		 385 aa  289  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.316107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  59.26 
 
 		 390 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0265  twitching motility protein PilT  62.04 
 
 		 376 aa  284  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0442  twitching motility protein  62.04 
 
 		 376 aa  284  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000650677 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  58.59 
 
 		 376 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3704  twitching motility protein  58.93 
 
 		 378 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  58.15 
 
 		 376 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2906  pilus retraction protein PilT  62.67 
 
 		 389 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.146208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2026  twitching motility protein  62.22 
 
 		 409 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.166451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  60.7 
 
 		 397 aa  274  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3033  twitching motility protein  63.59 
 
 		 391 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  57.6 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  57.6 
 
 		 373 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  59.07 
 
 		 390 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3082  pilus retraction protein PilT  61.9 
 
 		 370 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.184525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  55.83 
 
 		 375 aa  258  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0077  twitching motility protein  56.22 
 
 		 384 aa  255  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03150  Tfp pilus assembly protein  54.84 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.602648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  54.95 
 
 		 364 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2412  twitching motility protein  50.21 
 
 		 372 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  54.88 
 
 		 402 aa  241  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0483  twitching motility protein  52.68 
 
 		 375 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1843  twitching motility protein  54.03 
 
 		 387 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0110864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2195  twitching motility protein  50.88 
 
 		 390 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4442  twitching motility protein  48.47 
 
 		 376 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1725  pilus retraction protein PilT  48.44 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.544613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1995  twitching motility protein  49.78 
 
 		 401 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.206221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3615  twitching motility protein  50.67 
 
 		 389 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2045  twitching motility protein  48.47 
 
 		 395 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.398089  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.85 
 
 		 366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0276  twitching motility protein  50.91 
 
 		 388 aa  215  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  49.1 
 
 		 382 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1811  twitching motility protein  45.57 
 
 		 380 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  50 
 
 		 366 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1891  twitching motility protein  47.62 
 
 		 387 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2068  twitching motility protein  47.62 
 
 		 387 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0618461  normal  0.330404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  46.19 
 
 		 383 aa  209  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2483  twitching motility protein  49.09 
 
 		 387 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0708894  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  50.46 
 
 		 358 aa  208  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  46.54 
 
 		 386 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  46.54 
 
 		 387 aa  204  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  47.25 
 
 		 388 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  48.85 
 
 		 437 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>