More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1214 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  100 
 
 		 396 aa  790    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  77.59 
 
 		 356 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  68.73 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  67.04 
 
 		 432 aa  471  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  64.56 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  64.12 
 
 		 366 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  53.12 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  52.97 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  53.64 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  56.62 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  54.12 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  52.77 
 
 		 388 aa  364  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  53.82 
 
 		 383 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  54.11 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  52.19 
 
 		 387 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  54.81 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  54.46 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  54.46 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  53.87 
 
 		 427 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0256  twitching motility protein  52.26 
 
 		 359 aa  352  7e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  52.35 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  51.62 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  51.9 
 
 		 387 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  51.44 
 
 		 383 aa  335  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  47.73 
 
 		 349 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  49.01 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  48.66 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.44 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  46.49 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.59 
 
 		 348 aa  312  7.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  45.92 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  48.39 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  45.61 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  46.2 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  48.48 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  45.13 
 
 		 382 aa  306  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  43.39 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  46.78 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  47.16 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  47.2 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  47.2 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  50.47 
 
 		 339 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  46.2 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  49.72 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  48.97 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  46.2 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  44.92 
 
 		 358 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  45.91 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  46.51 
 
 		 356 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  48.19 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  48.12 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  43.27 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  44.8 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  49.24 
 
 		 566 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  46.2 
 
 		 366 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  45.91 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  44.84 
 
 		 344 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  47.06 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  44.19 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  45.91 
 
 		 358 aa  296  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  46.29 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  45.91 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  46.2 
 
 		 365 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  46.53 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  44.57 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  45.24 
 
 		 345 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.54 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  44.44 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  46.3 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  49.7 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  46.18 
 
 		 344 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  46.18 
 
 		 344 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  45.03 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1387  twitching motility protein  43.14 
 
 		 364 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  44.8 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  45.45 
 
 		 347 aa  290  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  45.22 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  45.61 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  45.59 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  45.75 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  45.72 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1632  twitching motility protein  42.09 
 
 		 378 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0705804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  45.81 
 
 		 346 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  45.51 
 
 		 360 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  45.32 
 
 		 358 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  45.01 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  42.86 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  45.35 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  43.99 
 
 		 347 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  43.14 
 
 		 358 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  45.51 
 
 		 346 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  44.28 
 
 		 345 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  42.37 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  45.97 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  44.91 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  43.93 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0166  twitching motility protein  43.92 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.197236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  41.33 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  42.09 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.31 
 
 		 345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>