More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6344 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  100 
 
 		 361 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  52.91 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  50.42 
 
 		 370 aa  358  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  51.25 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  53.49 
 
 		 357 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  54.07 
 
 		 356 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  50.28 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  50.28 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  50.28 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  52.17 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  51.88 
 
 		 356 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  46.42 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  45.85 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  45.85 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  46 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  44.6 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  45.14 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  44.03 
 
 		 427 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  43.75 
 
 		 427 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  44.03 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  43.27 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  44.92 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.63 
 
 		 388 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  45.85 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  44.99 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  41.5 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  42.74 
 
 		 375 aa  279  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  45.24 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  40.96 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  41.95 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  42.74 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  43.39 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  45.37 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  41.88 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  40.92 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1305  twitching mobility protein  43.59 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0603  twitching motility protein  42.24 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  40.11 
 
 		 365 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  43.3 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  40.38 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  40.4 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  40.57 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  42.45 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  40.92 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  42.53 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  39.32 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  39.32 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  40.35 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  39.32 
 
 		 366 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  40.17 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  39.32 
 
 		 366 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0117  twitching motility protein  43.27 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  39.55 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  40.63 
 
 		 344 aa  261  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  41.48 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  39.77 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  39.55 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  40.35 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  41.08 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  40.06 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  39.94 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  41.09 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  41.62 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  41.62 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  39.43 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  40.56 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0229  twitching motility protein  44.03 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  43.07 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  39.94 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  38.75 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  40.96 
 
 		 350 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  38.98 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  39.32 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  39.61 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  42.69 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  41.79 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  40.35 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  42.53 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  40.92 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  38.46 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  40.92 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  41.57 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  40.92 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  39.2 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  38.07 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  41.28 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  39.6 
 
 		 350 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  40.06 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  40.06 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  43.15 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  40.63 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  42.13 
 
 		 360 aa  255  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  39.66 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  41.19 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  41.52 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  41.16 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  41.21 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  39.15 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.52 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  41.89 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>