More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2899 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  100 
 
 
370 aa  751    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  98.92 
 
 
370 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  91.08 
 
 
370 aa  702    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  100 
 
 
370 aa  751    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  50.28 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2031  twitching motility protein  47.89 
 
 
356 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0174  twitching motility protein  46.35 
 
 
356 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000536243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0192  twitching motility protein  46.07 
 
 
356 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2966  twitching motility protein  47.58 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0260  pilus retraction protein PilT  46.72 
 
 
356 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0840945  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0230  twitching motility protein PilT  46.44 
 
 
356 aa  315  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.571301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  46.07 
 
 
372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  46.97 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  41.69 
 
 
358 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  43.49 
 
 
427 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  42.86 
 
 
427 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  42.86 
 
 
427 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  43.14 
 
 
437 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  42.82 
 
 
388 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  42.78 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  42.07 
 
 
383 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.21 
 
 
348 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.77 
 
 
339 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  42.11 
 
 
372 aa  278  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  40.17 
 
 
351 aa  276  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  45.27 
 
 
360 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  42.66 
 
 
366 aa  275  9e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  39.04 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  43.1 
 
 
358 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  40.34 
 
 
383 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  40.73 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  40.46 
 
 
383 aa  272  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  40.29 
 
 
383 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  39.83 
 
 
365 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  41.83 
 
 
366 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  40.74 
 
 
386 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  41.69 
 
 
351 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  39.28 
 
 
365 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  45.48 
 
 
344 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  39.08 
 
 
349 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  43.64 
 
 
360 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  40.59 
 
 
347 aa  265  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  41.25 
 
 
347 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  41.25 
 
 
347 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  41.57 
 
 
368 aa  263  4e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  41.52 
 
 
347 aa  262  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  40.52 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  42.03 
 
 
382 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  39.89 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  41.93 
 
 
347 aa  262  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  39.6 
 
 
366 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  39.42 
 
 
356 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  39.89 
 
 
366 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  39.32 
 
 
365 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  39.19 
 
 
375 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  43.19 
 
 
403 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  40.23 
 
 
350 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  41.71 
 
 
360 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  40.23 
 
 
350 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  40.95 
 
 
347 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  41.03 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  39.71 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  39.03 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  38.89 
 
 
365 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  40.92 
 
 
362 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  41.9 
 
 
375 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0532  twitching motility protein  40.95 
 
 
350 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  37.54 
 
 
374 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  41.38 
 
 
347 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.06 
 
 
344 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  41.86 
 
 
378 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  41.8 
 
 
345 aa  256  5e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  41.24 
 
 
391 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.39 
 
 
352 aa  255  9e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  42.24 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1584  twitching motility protein  42.23 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  40.23 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  38.46 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  37.86 
 
 
360 aa  253  3e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  40.99 
 
 
347 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  40.99 
 
 
360 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  40.63 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  38.46 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  42.11 
 
 
346 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  38.76 
 
 
388 aa  252  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  38.15 
 
 
363 aa  252  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  36.41 
 
 
362 aa  252  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  37.28 
 
 
360 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  39.36 
 
 
345 aa  252  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  37.64 
 
 
366 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  40.87 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  40.8 
 
 
430 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  42.11 
 
 
346 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.39 
 
 
351 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  39.89 
 
 
365 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  41.61 
 
 
347 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  38.18 
 
 
366 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0097  twitching motility protein  38.2 
 
 
357 aa  251  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.767539  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  40.95 
 
 
344 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  38.94 
 
 
363 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>