More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0689 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0689  twitching motility protein  100 
 
 
391 aa  799    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1694  twitching motility protein  47.7 
 
 
389 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12412  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3052  twitching motility protein  46 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1916  twitching motility protein  43.01 
 
 
393 aa  308  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.368763 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1132  twitching motility protein  45.53 
 
 
391 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  45.3 
 
 
366 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  43.63 
 
 
383 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  44.6 
 
 
349 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  41.85 
 
 
388 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  42.27 
 
 
387 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  42.82 
 
 
437 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  44.09 
 
 
388 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  42.55 
 
 
427 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  43.09 
 
 
427 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  42.55 
 
 
427 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  41.83 
 
 
386 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  42.66 
 
 
383 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  45.21 
 
 
403 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  43.09 
 
 
366 aa  279  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  44.22 
 
 
360 aa  278  8e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  42.39 
 
 
383 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1066  twitching motility protein  43.14 
 
 
358 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  47.28 
 
 
339 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  44.25 
 
 
362 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  42.29 
 
 
387 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  41.57 
 
 
350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  40.56 
 
 
351 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  41.58 
 
 
383 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  44.54 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  44.44 
 
 
375 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  43.88 
 
 
360 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  43.92 
 
 
351 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1038  twitching mobility protein  42.58 
 
 
358 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  41.19 
 
 
365 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  43.94 
 
 
345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0669  twitching motility protein  42.7 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.278448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  49.45 
 
 
344 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  41.18 
 
 
375 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  42.19 
 
 
365 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0550  twitching motility protein  44.44 
 
 
356 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  41.08 
 
 
397 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  42.2 
 
 
360 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  40.46 
 
 
366 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  44.64 
 
 
367 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  43.73 
 
 
347 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  40.17 
 
 
366 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  43.82 
 
 
348 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  44.21 
 
 
345 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  42.29 
 
 
351 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  44.34 
 
 
347 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  42.54 
 
 
358 aa  262  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  40.99 
 
 
362 aa  263  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  42.14 
 
 
346 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  40.29 
 
 
365 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  44.04 
 
 
347 aa  262  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  41.69 
 
 
370 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  40.52 
 
 
430 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  41.38 
 
 
365 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  40.29 
 
 
366 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  41.64 
 
 
566 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  44.05 
 
 
350 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  42.81 
 
 
346 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  43.75 
 
 
350 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.57 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  40.6 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  40 
 
 
366 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  42.01 
 
 
349 aa  258  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  39.71 
 
 
366 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2705  twitching motility protein  41.29 
 
 
370 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.48227  normal  0.974837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  40.68 
 
 
362 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0361  twitching motility protein  41.29 
 
 
372 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000675189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  43.7 
 
 
372 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  42.94 
 
 
356 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  41.42 
 
 
345 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  41.27 
 
 
344 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  38.59 
 
 
374 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2899  twitching motility protein  41.24 
 
 
370 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.703969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2714  twitching motility protein  41.24 
 
 
370 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2806  twitching motility protein  41.24 
 
 
370 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0335  twitching motility protein PilT  45.57 
 
 
398 aa  256  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  40.59 
 
 
378 aa  255  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  43.45 
 
 
360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  41.12 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  41.12 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6344  twitching motility protein  41.89 
 
 
361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  41.12 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  41.42 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  41.42 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  42.01 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  41.12 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  41.72 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  41.42 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  43.27 
 
 
360 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  44.38 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  39.76 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  42.01 
 
 
345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  41.42 
 
 
345 aa  252  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  46.42 
 
 
347 aa  252  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  38.06 
 
 
365 aa  252  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  41.12 
 
 
345 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>