More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0831 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  100 
 
 		 374 aa  764    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  99.73 
 
 		 374 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  62.92 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  60.12 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  60.18 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0137  hypothetical protein  98.41 
 
 		 209 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3337  twitching mobility protein  98.96 
 
 		 207 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  58.66 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  62.42 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  57.23 
 
 		 326 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  55.86 
 
 		 326 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  56.92 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  56.62 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  56.62 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  56.92 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  56.31 
 
 		 326 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  56.62 
 
 		 326 aa  348  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  56 
 
 		 326 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  56 
 
 		 326 aa  348  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  54.27 
 
 		 326 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  54.27 
 
 		 326 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  54.27 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  53.66 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  53.66 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  50.46 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50 
 
 		 346 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  49.69 
 
 		 346 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  49.53 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.09 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  47.58 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  49.52 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  48.15 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  48.94 
 
 		 344 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  48.94 
 
 		 344 aa  322  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  47.42 
 
 		 347 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  48.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  48.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  49.09 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  48.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  48.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  48.15 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.21 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  47.84 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  47.84 
 
 		 349 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  47.53 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  49.84 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  49.52 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  49.69 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.02 
 
 		 347 aa  319  6e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  47.22 
 
 		 345 aa  319  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  47.53 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  45.95 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.9 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.9 
 
 		 347 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  50.32 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  46.2 
 
 		 345 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  45.35 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  47.35 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  46.61 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  48.59 
 
 		 397 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  46.71 
 
 		 347 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  46.2 
 
 		 344 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  45.48 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  46.5 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  46.53 
 
 		 347 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  46.67 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  46.2 
 
 		 344 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  46.06 
 
 		 344 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  45.62 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  45.15 
 
 		 344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.47 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48.45 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  45.92 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  45.92 
 
 		 347 aa  308  9e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48.45 
 
 		 349 aa  308  9e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  47.15 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  45.15 
 
 		 344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  47.04 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  46.67 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  46.22 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  44.74 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  45.35 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  45.68 
 
 		 349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  45.09 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  47.98 
 
 		 347 aa  305  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  47.11 
 
 		 332 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  44.85 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  45.15 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  45.15 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  45.92 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  45.45 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  45.15 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  44.71 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  47.98 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  46.22 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>