More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4966 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  99.1 
 
 		 336 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  100 
 
 		 332 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  89.46 
 
 		 332 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  80.85 
 
 		 332 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  50.46 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  51.06 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  51.06 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  52.28 
 
 		 344 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  50.46 
 
 		 345 aa  361  8e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.46 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.46 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.46 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.85 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  50.76 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.15 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  48.94 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  50.15 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  49.85 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  49.24 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50.15 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  48.63 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  49.85 
 
 		 345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  51.06 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.46 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  49.54 
 
 		 344 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  48.63 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  49.24 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  48.63 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  51.06 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  49.24 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  50.76 
 
 		 346 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  48.63 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  50.46 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  48.63 
 
 		 345 aa  350  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  50.15 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  49.39 
 
 		 347 aa  350  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  49.24 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  48.94 
 
 		 344 aa  348  5e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  48.94 
 
 		 345 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  48.94 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  48.94 
 
 		 350 aa  348  8e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  49.54 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  49.24 
 
 		 344 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  49.54 
 
 		 344 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  48.04 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  49.85 
 
 		 345 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  49.4 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  48.63 
 
 		 349 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  48.01 
 
 		 349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.58 
 
 		 347 aa  341  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  47.88 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  47.72 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.04 
 
 		 347 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  49.24 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  47.13 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  47.13 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  48.46 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  48.46 
 
 		 349 aa  332  6e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  48.48 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.58 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  47.73 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1884  twitching motility protein  49.24 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  48.18 
 
 		 347 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  48.18 
 
 		 347 aa  321  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  46.97 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  47.27 
 
 		 347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  46.97 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  46.97 
 
 		 347 aa  318  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  45.76 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  46.97 
 
 		 347 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  45.76 
 
 		 347 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  46.36 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  44.98 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0460  twitching motility protein  49.39 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.16697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  47.11 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  47.11 
 
 		 374 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  46.77 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  47.42 
 
 		 356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  48.7 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  46.37 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  46.76 
 
 		 360 aa  298  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  47.8 
 
 		 372 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  45.59 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  50.76 
 
 		 339 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  51.21 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  47.35 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  50.61 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  43.33 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  46.89 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  49.55 
 
 		 338 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  53.01 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  47 
 
 		 369 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  45.82 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  48.94 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3244  twitching motility protein  43.07 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>