More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4029 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  100 
 
 		 340 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  67.58 
 
 		 340 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  65.26 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  63.64 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  64.85 
 
 		 346 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  62.42 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  62.42 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  58.73 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  58.73 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  59.04 
 
 		 341 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  58.13 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  58.43 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  58.43 
 
 		 326 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  58.43 
 
 		 326 aa  360  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  58.13 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  59.04 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  59.7 
 
 		 326 aa  358  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  58.79 
 
 		 326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  52.51 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  58.79 
 
 		 326 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  58.79 
 
 		 326 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  58.43 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  58.79 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  51.36 
 
 		 349 aa  352  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  51.21 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  51.52 
 
 		 347 aa  348  9e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  50.76 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  50.76 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  50.89 
 
 		 344 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  51.52 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  50.3 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  50.6 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  50.91 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  50.91 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  50.91 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  50.91 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  49.39 
 
 		 345 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  50.91 
 
 		 345 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  50.61 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  50.61 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  50.61 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  49.85 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  50.3 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  50.91 
 
 		 345 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  50.3 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  51.52 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  50.3 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  49.7 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  50.6 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  49.7 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  49.26 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  51.55 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  51.55 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  50 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  50.61 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  50 
 
 		 344 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  50 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  49.85 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  49.7 
 
 		 344 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  49.85 
 
 		 344 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0316  twitching motility protein  50.61 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.436596  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  48.14 
 
 		 347 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  48.96 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  47.28 
 
 		 347 aa  322  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  50.61 
 
 		 346 aa  322  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  48.66 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  48.66 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  46.73 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  48.96 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  46.73 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  49.39 
 
 		 345 aa  318  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  50 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  49.39 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  47.88 
 
 		 344 aa  316  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  53.01 
 
 		 332 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  53.01 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  52.99 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  51.06 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  49.22 
 
 		 368 aa  312  3.9999999999999997e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  47.88 
 
 		 344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  48.04 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  47.46 
 
 		 347 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  47.29 
 
 		 347 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  49.08 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  49.08 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1038  twitching motility protein  48.94 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  46.87 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  46.87 
 
 		 347 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  48.93 
 
 		 360 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  46.27 
 
 		 347 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  47.43 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  48.19 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  48.77 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  48.02 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  46.83 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  49.22 
 
 		 370 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  47.76 
 
 		 347 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  51.94 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  48.45 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>