More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3337 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3337  twitching mobility protein  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0831  twitching motility protein  98.96 
 
 
374 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.859854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0833  twitching motility protein  98.96 
 
 
374 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4029  twitching motility protein  69.52 
 
 
340 aa  265  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.364781  hitchhiker  0.00141346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0761  twitching motility protein  69.35 
 
 
340 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0776  twitching motility protein  66.13 
 
 
346 aa  253  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3449  twitching motility protein  65.08 
 
 
338 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0548659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3606  twitching motility protein  65.78 
 
 
338 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3356  twitching motility protein  64.52 
 
 
326 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3294  twitching motility family protein  61.83 
 
 
326 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4253  twitching motility family protein  61.83 
 
 
341 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.626068  normal  0.518101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0745  twitching motility protein  61.29 
 
 
326 aa  228  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.55991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3110  twitching motility family protein  61.29 
 
 
326 aa  228  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0764  twitching motility protein  61.29 
 
 
326 aa  228  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.160619  hitchhiker  0.0000267931 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3382  twitching motility family protein  61.83 
 
 
326 aa  228  6e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02780  predicted transporter  60.75 
 
 
326 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02743  hypothetical protein  60.75 
 
 
326 aa  227  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.390847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3092  twitching motility family protein  61.29 
 
 
341 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  57.22 
 
 
349 aa  225  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  55.61 
 
 
346 aa  224  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3273  twitching mobility protein  60.75 
 
 
326 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0500481 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3262  twitching mobility protein  60.75 
 
 
326 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  57.54 
 
 
344 aa  223  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  55.08 
 
 
346 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3346  twitching mobility protein  60.75 
 
 
326 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732924  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01993  twitching motility protein  57.14 
 
 
345 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.913118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  57.3 
 
 
362 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  55.61 
 
 
347 aa  222  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3442  twitching motility protein PilT  60.75 
 
 
326 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.091783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3338  twitching mobility protein  60.75 
 
 
326 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.394919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0931  twitching motility protein  56.61 
 
 
345 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413956  normal  0.826545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  53.68 
 
 
347 aa  220  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  54.64 
 
 
347 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  55.98 
 
 
344 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1253  twitching motility protein  56.45 
 
 
344 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1221  twitching motility protein  56.45 
 
 
344 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.475571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  54.01 
 
 
344 aa  219  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  54.79 
 
 
347 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  54.3 
 
 
344 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  53.72 
 
 
347 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  55.38 
 
 
345 aa  218  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  54.3 
 
 
345 aa  218  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  56.15 
 
 
344 aa  218  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  53.48 
 
 
346 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  54.79 
 
 
566 aa  218  7e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  55.93 
 
 
349 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5143  twitching motility protein  55.91 
 
 
332 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.847516  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  54.3 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  53.76 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  55.43 
 
 
347 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  57.63 
 
 
347 aa  216  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4966  twitching motility protein  56.28 
 
 
332 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  54.3 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  56.76 
 
 
397 aa  217  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  53.76 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  53.76 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  54.3 
 
 
345 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  54.3 
 
 
345 aa  216  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  54.3 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  54.3 
 
 
345 aa  216  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  53.76 
 
 
345 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5093  twitching motility protein  56.28 
 
 
336 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  54.3 
 
 
344 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  53.76 
 
 
347 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  55.08 
 
 
347 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  55.08 
 
 
347 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  54.89 
 
 
345 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  52.66 
 
 
347 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  52.69 
 
 
345 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  54.01 
 
 
349 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  54.35 
 
 
345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  54.01 
 
 
344 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  54.01 
 
 
344 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.94 
 
 
344 aa  214  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  54.89 
 
 
344 aa  214  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  52.94 
 
 
344 aa  214  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  53.44 
 
 
347 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  56.38 
 
 
347 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  55.08 
 
 
347 aa  214  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  53.23 
 
 
345 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  54.01 
 
 
347 aa  214  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0372  twitching motility protein  55.61 
 
 
332 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  56.74 
 
 
347 aa  214  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  54.01 
 
 
358 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  54.3 
 
 
344 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  52.11 
 
 
344 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.19 
 
 
360 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  54.55 
 
 
345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  54.3 
 
 
345 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3004  pilus retraction protein PilT  56.22 
 
 
345 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  51.6 
 
 
347 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  51.6 
 
 
347 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  54.3 
 
 
347 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  56.67 
 
 
349 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  53.8 
 
 
344 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  56.67 
 
 
349 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  55.74 
 
 
344 aa  211  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  56.74 
 
 
347 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  54.55 
 
 
339 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  52.66 
 
 
347 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>