33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1440 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1440  prophage CP4-57 integrase  100 
 
 		 58 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.294071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2981  phage integrase family protein  94.87 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.551664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  92.31 
 
 		 399 aa  76.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2895  phage integrase family protein  92.31 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  89.74 
 
 		 403 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  82.05 
 
 		 398 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  76.92 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  56.86 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  71.79 
 
 		 395 aa  61.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2876  DotU family type IV/VI secretion system protein  66.67 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  58.97 
 
 		 413 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  57.5 
 
 		 409 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0137  hypothetical protein  88.46 
 
 		 209 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3673  insertion sequence transposase  100 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000238306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1940  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000050043  normal  0.408883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  55 
 
 		 413 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2676  hypothetical protein  92 
 
 		 41 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.581829  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0633  hypothetical protein  92 
 
 		 46 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0250411  normal  0.0743119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  58.97 
 
 		 416 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  52.5 
 
 		 421 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  45.1 
 
 		 439 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  55 
 
 		 415 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  55 
 
 		 413 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5703  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  56.41 
 
 		 416 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  51.28 
 
 		 402 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  47.5 
 
 		 413 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3064  Phage integrase  51.28 
 
 		 438 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  47.5 
 
 		 415 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  43.59 
 
 		 410 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  47.5 
 
 		 420 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  46.15 
 
 		 404 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  37.93 
 
 		 419 aa  40  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>