More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1902 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  100 
 
 		 416 aa  860    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  92.55 
 
 		 416 aa  781    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  68.69 
 
 		 413 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  62.59 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  60.66 
 
 		 397 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  61.2 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  58.31 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  58.84 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  60.41 
 
 		 403 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  59.71 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  58.06 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  57.11 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  52.54 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  53 
 
 		 414 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  51.94 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  52.06 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  50.62 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  51.75 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  53.3 
 
 		 412 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  51.75 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  48.91 
 
 		 416 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  50.62 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  49.63 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  49.38 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  50.37 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  48.64 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  48.85 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  48.4 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  50.89 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  49.03 
 
 		 413 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  46.48 
 
 		 410 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  47.2 
 
 		 411 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  46.72 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  46.72 
 
 		 411 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  46.59 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  45.75 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  46.59 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  46.59 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  46.52 
 
 		 414 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  43.64 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  41.65 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  44.06 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  46.38 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.61 
 
 		 404 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  38.46 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.87 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.01 
 
 		 394 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.43 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  34.43 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  34.43 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  34.35 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  36.05 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  33.92 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  34.96 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  33.84 
 
 		 404 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.5 
 
 		 402 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  35.88 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  33.99 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  35.24 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  37.12 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  36.8 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  34.18 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  34.18 
 
 		 394 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  34.5 
 
 		 401 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  34.02 
 
 		 410 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  35.31 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  35.31 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  35.4 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  37.6 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  38.96 
 
 		 402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  36.34 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  36.32 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  36.6 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  35.06 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.68 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.42 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  35.97 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  33.85 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  35.52 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  33.42 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  36.45 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  33.68 
 
 		 417 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  36.09 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  36.24 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  33.76 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  34.99 
 
 		 419 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.5 
 
 		 402 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  34.63 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  34.37 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  35.89 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  35.09 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  33.91 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  33.49 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  35.31 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  35.73 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  34.75 
 
 		 419 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  36.12 
 
 		 420 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  33.94 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  32.66 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  36.17 
 
 		 423 aa  246  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>