More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0299 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  97.67 
 
 		 402 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 394 aa  820    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  71.07 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  63.99 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  63.2 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  65.03 
 
 		 387 aa  528  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  63.2 
 
 		 404 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  63.2 
 
 		 404 aa  529  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  62.69 
 
 		 410 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  62.4 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  62.4 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  61.14 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  61.72 
 
 		 404 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  63.21 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  61.66 
 
 		 404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  60.62 
 
 		 402 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  61.03 
 
 		 394 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  60.51 
 
 		 394 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  61.03 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  59.33 
 
 		 397 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  58.02 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  57.43 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  59.59 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  57.77 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  58.81 
 
 		 409 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  57.29 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  56.74 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  55.7 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  60.96 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  47.61 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  46.17 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  46.75 
 
 		 385 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  46.49 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  45.32 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  45.41 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.44 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  44.28 
 
 		 421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  44.3 
 
 		 402 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  46.43 
 
 		 401 aa  338  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  44.13 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  45.1 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  43.07 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  43.07 
 
 		 419 aa  332  5e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  44.02 
 
 		 407 aa  332  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.86 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  47.29 
 
 		 406 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  43.22 
 
 		 404 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  41.73 
 
 		 394 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.29 
 
 		 420 aa  324  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  41.04 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  41.54 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  41.5 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  43.59 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  43.29 
 
 		 404 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  41.34 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  44.1 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  41.94 
 
 		 411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  46.05 
 
 		 402 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  43.15 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  44.47 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.55 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  43.29 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  41.94 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  40.55 
 
 		 421 aa  315  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  44.22 
 
 		 413 aa  315  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  44.33 
 
 		 389 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  41.54 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  43.22 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  43.03 
 
 		 429 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  42.75 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  42.89 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  42 
 
 		 421 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  43.93 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  42.56 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  42 
 
 		 419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  41.54 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  41.39 
 
 		 393 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  40.41 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  42.49 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  41.5 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42.93 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  42.49 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  43.67 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  41.34 
 
 		 403 aa  301  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.1 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  40.16 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  39.05 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  43.99 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  40.26 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  39.22 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  40.97 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  40.71 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  40.1 
 
 		 421 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  40.67 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  41.71 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  38.48 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  42.64 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  38.24 
 
 		 419 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  40.36 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>