More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0968 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  100 
 
 		 391 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  59.34 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  59.85 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  59.85 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  57.29 
 
 		 438 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  58.82 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  58.57 
 
 		 404 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  58.57 
 
 		 404 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  51.28 
 
 		 394 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  51.28 
 
 		 394 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  50.64 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  49.1 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  51.02 
 
 		 407 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  51.01 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  50.51 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  48.72 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  48.72 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  47.58 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  48.47 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  48.44 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  49.36 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  46.94 
 
 		 404 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  46.68 
 
 		 404 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  47.55 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  46.43 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  46.68 
 
 		 404 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  46.95 
 
 		 396 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  47.67 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  47.36 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  47.8 
 
 		 402 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.82 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.31 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  47.06 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  46.17 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  47.45 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  44.82 
 
 		 387 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  47.41 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  45.08 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  45.08 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  49.23 
 
 		 406 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  46.51 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  47.63 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  46.82 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  46.41 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  45.94 
 
 		 403 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  46.31 
 
 		 407 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  45.52 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  46.87 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  45.27 
 
 		 394 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  46.15 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  46.4 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  45.3 
 
 		 420 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  45.91 
 
 		 421 aa  342  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  45.5 
 
 		 411 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  45.16 
 
 		 410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  45.91 
 
 		 421 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  45.16 
 
 		 419 aa  338  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  47.77 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  43.65 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  46.56 
 
 		 419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  43.39 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.41 
 
 		 421 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  44.99 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  45.55 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  44.84 
 
 		 411 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  45.95 
 
 		 417 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  45.84 
 
 		 425 aa  332  9e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  46.92 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  44.91 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  48.2 
 
 		 427 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  46.4 
 
 		 419 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  45.43 
 
 		 401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  45.16 
 
 		 421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  44.25 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  44.92 
 
 		 404 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  43.49 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  45.66 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  45.66 
 
 		 402 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  43.42 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  43.42 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  43.9 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  43.42 
 
 		 419 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  45.45 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  45.1 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  44.62 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.68 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  45.43 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  46.43 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  42.53 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  44.42 
 
 		 445 aa  310  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  41.33 
 
 		 415 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  42.49 
 
 		 412 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  43.51 
 
 		 462 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  41.22 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  41.98 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  41.98 
 
 		 419 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  41.61 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  45.55 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  43.37 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>