More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4153 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 397 aa  818    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  80.36 
 
 		 387 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  80.62 
 
 		 389 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  80.36 
 
 		 391 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  71.24 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  71.24 
 
 		 394 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  70.98 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  70.21 
 
 		 396 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  62.85 
 
 		 410 aa  542  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  63.33 
 
 		 409 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  61.77 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  65.63 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  62.44 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  60.62 
 
 		 404 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  60.36 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  62.18 
 
 		 404 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  60.78 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  59.84 
 
 		 402 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  61.92 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  61.92 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  59.84 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  59.33 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  60.31 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  55.36 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.96 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.7 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  56.22 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  54.95 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  57.58 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  48.44 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  46.77 
 
 		 401 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  47.27 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  46.75 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  45.62 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  45.66 
 
 		 404 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  47.03 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  42.64 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.07 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.89 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.89 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.89 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  45.01 
 
 		 407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  45.64 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  43.7 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  45.09 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  44.96 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  44.99 
 
 		 406 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  40.3 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  40.3 
 
 		 419 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  41.04 
 
 		 420 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  41.27 
 
 		 394 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  39.8 
 
 		 420 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.04 
 
 		 420 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  40.5 
 
 		 421 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.79 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  42.89 
 
 		 391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  41.75 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  42.93 
 
 		 413 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.78 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  39.55 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  40.8 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  42.78 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  42.64 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  40.87 
 
 		 393 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  42.78 
 
 		 401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  42.93 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  40.29 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  41.07 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  42.39 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  40.51 
 
 		 407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  40.3 
 
 		 419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  41.52 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  40.51 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  40.26 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  40.82 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  39.05 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  38.94 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  39.01 
 
 		 390 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  39.49 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  39.05 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  42.82 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  40.55 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  42.64 
 
 		 414 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  39.85 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  38.71 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  39.12 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  38.66 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  38.63 
 
 		 425 aa  292  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  40.87 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  39.07 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  38.63 
 
 		 428 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  38.05 
 
 		 403 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  38.56 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  38.21 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  38.66 
 
 		 396 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  41.73 
 
 		 618 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  38.4 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  38.4 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  36 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>