More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3385 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 391 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  64.6 
 
 		 393 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  43.33 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  43.48 
 
 		 401 aa  345  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  42.89 
 
 		 397 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  43.73 
 
 		 402 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  41.34 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  41.54 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  41.34 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  41.04 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  40.83 
 
 		 409 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  39.53 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  42.23 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  40.87 
 
 		 402 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  40.05 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  40 
 
 		 394 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  40 
 
 		 394 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  39.49 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  39.74 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  39.79 
 
 		 404 aa  292  6e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  39.79 
 
 		 404 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  40.36 
 
 		 396 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.3 
 
 		 402 aa  289  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  38.5 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  38.92 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.05 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.31 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  38.66 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.05 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  38.66 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3466  integrase family protein  40.59 
 
 		 644 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  39.19 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  38.7 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0697  integrase family protein  39.6 
 
 		 618 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2408  integrase (int)  40.2 
 
 		 617 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.71715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1977  phage integrase family protein  39.71 
 
 		 617 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.602154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  37.79 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1597  integrase family protein  38.37 
 
 		 602 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.754785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  37.59 
 
 		 601 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  37.34 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1340  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.680009  normal  0.929089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1097  putative phage integrase  37.44 
 
 		 643 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  36.2 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  35.92 
 
 		 413 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  36.98 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  36.04 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  36.72 
 
 		 397 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  34.63 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  32.82 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  34.54 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  35.92 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5324  integrase  36.34 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4139  integrase family protein  35.47 
 
 		 642 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217214  hitchhiker  0.0000125149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  34.88 
 
 		 413 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  34.45 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  35.8 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  36.9 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  35.38 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  35.82 
 
 		 395 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.8 
 
 		 420 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  34.28 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  34.68 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  34.62 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  35.77 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  34.03 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1213  phage integrase family protein  37.63 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550435  normal  0.724829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  36.64 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  31.96 
 
 		 416 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  34.54 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.96 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  35.71 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  35.31 
 
 		 421 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  37.31 
 
 		 406 aa  235  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  35.42 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  35.45 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  34.2 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  37.31 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  34.86 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  35.4 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.32 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  35.31 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.48 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  33.25 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  32.56 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  35.03 
 
 		 401 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  37.37 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  36.04 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  33.08 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  33.59 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.5 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  33.59 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  33 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  35.98 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34.78 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  34.9 
 
 		 419 aa  229  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  33.85 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  33.83 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>