More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3582 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  97.92 
 
 
385 aa  781    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  100 
 
 
397 aa  822    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  49.74 
 
 
396 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  48.45 
 
 
394 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  48.21 
 
 
417 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  48.45 
 
 
394 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  48.18 
 
 
389 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  47.18 
 
 
391 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  47.81 
 
 
396 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  47.27 
 
 
387 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  46.75 
 
 
397 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  46.94 
 
 
395 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  45.99 
 
 
396 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.99 
 
 
394 aa  362  6e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  44.44 
 
 
402 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  46.49 
 
 
394 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.74 
 
 
394 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  44.04 
 
 
404 aa  360  3e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  44.36 
 
 
404 aa  359  5e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  45.48 
 
 
402 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  43.85 
 
 
404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  43.59 
 
 
404 aa  355  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  44.3 
 
 
404 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  44.3 
 
 
404 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  44.04 
 
 
404 aa  353  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  45.08 
 
 
409 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  45.65 
 
 
387 aa  346  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  44.19 
 
 
396 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  41.45 
 
 
401 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  43.8 
 
 
410 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  43.94 
 
 
367 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.68 
 
 
391 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  41.65 
 
 
401 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  35.32 
 
 
394 aa  269  7e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  36.34 
 
 
404 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  37.44 
 
 
402 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36.18 
 
 
401 aa  259  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  38.02 
 
 
393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  37.15 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  35.9 
 
 
438 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  37.85 
 
 
401 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  36.72 
 
 
391 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  37.09 
 
 
403 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  35.88 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  35.37 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  35.99 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  38.27 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  35.73 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  35.73 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.37 
 
 
402 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  36.41 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.48 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  34.25 
 
 
421 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  34.65 
 
 
421 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  34.07 
 
 
421 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  34.96 
 
 
420 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  33.42 
 
 
419 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  33.93 
 
 
402 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  35.73 
 
 
407 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  36.25 
 
 
404 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  34.07 
 
 
419 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  35.52 
 
 
413 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  33.17 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  35.7 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  33.17 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  34.46 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.41 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  36.25 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.41 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  34.01 
 
 
407 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  34.62 
 
 
400 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  34.41 
 
 
420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  34.01 
 
 
405 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  33.75 
 
 
411 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  33.17 
 
 
419 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  32.67 
 
 
419 aa  230  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  34.33 
 
 
421 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  34.08 
 
 
421 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  33.33 
 
 
412 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.33 
 
 
422 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  32.42 
 
 
419 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  34.94 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  32.91 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  34.41 
 
 
419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  34.44 
 
 
389 aa  225  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  35.11 
 
 
398 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0444  phage integrase  34.81 
 
 
417 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.159341  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  34.09 
 
 
419 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  35.22 
 
 
402 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  33.33 
 
 
413 aa  223  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  33.99 
 
 
428 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  32.76 
 
 
429 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  32.67 
 
 
420 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  33.75 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  33.17 
 
 
421 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  32.66 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  33 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  36.06 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  33 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  31.78 
 
 
421 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>