More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0912 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  100 
 
 		 413 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  60.98 
 
 		 406 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  60.63 
 
 		 421 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  61.27 
 
 		 403 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  61.54 
 
 		 411 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  60.87 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  61.65 
 
 		 403 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  59.56 
 
 		 406 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  60.39 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  59.9 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  58.64 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  58.05 
 
 		 404 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  58.72 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  59.84 
 
 		 378 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  55.99 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  56.14 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  56.55 
 
 		 407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  52.68 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  53.9 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  53.3 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  53.96 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  51.08 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  53.1 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  53.77 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  52.52 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  52.08 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  50.88 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  49.87 
 
 		 394 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  51.34 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  52.14 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  47.43 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  48.89 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  49.88 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  49.76 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  50 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2460  phage integrase family protein  46.72 
 
 		 413 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269087  normal  0.494365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  49.28 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  49.28 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  48.79 
 
 		 404 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  46.87 
 
 		 391 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  46.32 
 
 		 398 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  48.44 
 
 		 412 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  45.71 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  45.86 
 
 		 395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.87 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  43.28 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  43.6 
 
 		 404 aa  335  9e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  43.03 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  45.25 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  46.86 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  46.96 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  43.35 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  43.28 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  43.35 
 
 		 404 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  42.93 
 
 		 402 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  44.58 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  44.26 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  45.52 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  49.75 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  43.39 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  43.39 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  44.11 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  44.78 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  43.18 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  45.84 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  44.11 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.86 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  43.86 
 
 		 396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  44.23 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  42.93 
 
 		 397 aa  319  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.36 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  45.39 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  43.07 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0676  phage integrase family site specific recombinase  53.53 
 
 		 303 aa  317  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.825642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  43.7 
 
 		 420 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  42.36 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  44.22 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  46.47 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.21 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  43.17 
 
 		 419 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  43.17 
 
 		 419 aa  310  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  43.21 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  41.88 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  45.65 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  45.65 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  42.13 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.72 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  42.82 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  43.53 
 
 		 417 aa  305  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  41.16 
 
 		 411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  41.59 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  42.16 
 
 		 421 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  41.48 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3701  phage integrase  54.41 
 
 		 276 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  41.67 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  40.4 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  40.15 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  40.86 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  41.46 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  41.11 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>