More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0662 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  100 
 
 		 417 aa  848    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  50.75 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  47.59 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  45.5 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  45.96 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  46.75 
 
 		 405 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  45.16 
 
 		 394 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  45.79 
 
 		 411 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  45.32 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  41.48 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  44.23 
 
 		 421 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  45.23 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  44.5 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  45 
 
 		 445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  42.72 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  43.32 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  44.29 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  43.53 
 
 		 413 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  41.48 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  42.28 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  44.36 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  42.07 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  43.29 
 
 		 402 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  42.64 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  39.4 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  40.1 
 
 		 395 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  39.4 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  39.4 
 
 		 404 aa  295  9e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  41.96 
 
 		 404 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.21 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.21 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  43.69 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  42.32 
 
 		 405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  41.35 
 
 		 407 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  40.95 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  41.81 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  40.89 
 
 		 427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  39.45 
 
 		 410 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  40.78 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  41.41 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  40.3 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  37.31 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  40.53 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  35.71 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  40.25 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.59 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.25 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  40.65 
 
 		 403 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  41.31 
 
 		 421 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  41.15 
 
 		 407 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  39.04 
 
 		 428 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  37.19 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  36.95 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  36.95 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  40 
 
 		 421 aa  275  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  39.9 
 
 		 462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  40.95 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  38.8 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  38.12 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  39.4 
 
 		 402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  39.31 
 
 		 419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  39.65 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  38.92 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.51 
 
 		 420 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  38.2 
 
 		 419 aa  272  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  41.48 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  39.76 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  39.71 
 
 		 413 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  39.01 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.51 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  38.2 
 
 		 420 aa  268  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0657  phage integrase family protein  41.42 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  40.1 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.32 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  38.55 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  38.54 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.78 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  38.27 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  38.31 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  39.01 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  39.75 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  37.06 
 
 		 409 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  38.63 
 
 		 419 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  38.1 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  39.8 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  38.54 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  38.73 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  38.07 
 
 		 419 aa  260  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  37.82 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  38.39 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  36.8 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  34.88 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  36.99 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.59 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  36.56 
 
 		 425 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  40.46 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  37.82 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  37.38 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  38.52 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>