More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0757 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  100 
 
 
419 aa  862    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  40.29 
 
 
445 aa  316  6e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  40.73 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  37.94 
 
 
420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  40 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  40.34 
 
 
394 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  37.32 
 
 
421 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  36.89 
 
 
404 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  38.35 
 
 
403 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  38.54 
 
 
400 aa  289  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  38.41 
 
 
397 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  37.41 
 
 
403 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  37.91 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  38.24 
 
 
396 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  38.72 
 
 
428 aa  282  9e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  38.2 
 
 
419 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.12 
 
 
391 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  39.61 
 
 
406 aa  279  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  38.16 
 
 
413 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  35.7 
 
 
404 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  37.44 
 
 
397 aa  276  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  38.21 
 
 
396 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  37.98 
 
 
421 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  35.7 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  37.3 
 
 
410 aa  274  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  36.54 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  36.75 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  36.47 
 
 
404 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  36.7 
 
 
410 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  38.94 
 
 
405 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  35.7 
 
 
404 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1143  phage integrase family protein  36.98 
 
 
412 aa  270  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  37.89 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  37.29 
 
 
404 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  38.85 
 
 
378 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  35.71 
 
 
391 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4495  integrase family protein  38.55 
 
 
409 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.338332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  35.94 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  36.34 
 
 
398 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  37.05 
 
 
404 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  36.67 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  36.67 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  35.7 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  36.74 
 
 
462 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  35.7 
 
 
404 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  36.8 
 
 
404 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  37.05 
 
 
402 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  35.47 
 
 
387 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  38.35 
 
 
429 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  36.71 
 
 
416 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  36.78 
 
 
407 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  36.59 
 
 
417 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  37.47 
 
 
404 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  37.47 
 
 
404 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  35.38 
 
 
402 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.96 
 
 
395 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  36.07 
 
 
389 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  36.78 
 
 
415 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0662  phage integrase family protein  34.88 
 
 
417 aa  257  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.421315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  36.39 
 
 
409 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  35.04 
 
 
394 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2200  integrase family protein  35.24 
 
 
415 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  35.7 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  35.11 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  36.74 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  36.32 
 
 
416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  37.56 
 
 
402 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.96 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  37.53 
 
 
404 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  35.17 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  36.34 
 
 
403 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  36.56 
 
 
401 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2301  integrase family protein  36.43 
 
 
403 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0308484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1216  phage integrase family protein  33.65 
 
 
402 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.190832  normal  0.145773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  34.66 
 
 
421 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0478  integrase family protein  36.08 
 
 
427 aa  249  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  33.66 
 
 
407 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  35.75 
 
 
395 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  33.98 
 
 
417 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2643  phage integrase family protein  34.6 
 
 
413 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 
438 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  35.92 
 
 
433 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  34.66 
 
 
419 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  34.58 
 
 
424 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.66 
 
 
419 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  34.38 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  37.5 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  35.84 
 
 
403 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  34.95 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  34.71 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  33.88 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  36.17 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  34.23 
 
 
401 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  34.72 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  34.31 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  34.22 
 
 
422 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  33.97 
 
 
409 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  35.42 
 
 
412 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  33.89 
 
 
398 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  36.62 
 
 
420 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0631504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>